Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apoa1Q00623 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apoa1Q00623 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apoa1Q00623 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apoa1Q00623 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apoa1Q00623 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apoa1Q00623 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apoa1Q00623 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apoa1Q00623 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apoa1Q00623 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apoa1Q00623 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apoa1Q00623 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apoa1Q00623 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apoa1Q00623 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apoa1Q00623 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apoa1Q00623 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apoa1Q00623 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apoa1Q00623 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apoa1Q00623 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apoa1Q00623 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apoa1Q00623 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apoa1Q00623 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apoa1Q00623 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apoa1Q00623 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apoa1Q00623 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apoa1Q00623 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apoa1Q00623 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apoa1Q00623 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apoa1Q00623 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apoa1Q00623 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apoa1Q00623 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apoa1Q00623 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apoa1Q00623 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apoa1Q00623 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apoa1Q00623 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apoa1Q00623 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Apoa1Q00623 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Apoa1Q00623 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Apoa1Q00623 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apoa1Q00623 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apoa1Q00623 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apoa1Q00623 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apoa1Q00623 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apoa1Q00623 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apoa1Q00623 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apoa1Q00623 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apoa1Q00623 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apoa1Q00623 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apoa1Q00623 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apoa1Q00623 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apoa1Q00623 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apoa1Q00623 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apoa1Q00623 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apoa1Q00623 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apoa1Q00623 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apoa1Q00623 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apoa1Q00623 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apoa1Q00623 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apoa1Q00623 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apoa1Q00623 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apoa1Q00623 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apoa1Q00623 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apoa1Q00623 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apoa1Q00623 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apoa1Q00623 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apoa1Q00623 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apoa1Q00623 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apoa1Q00623 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apoa1Q00623 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apoa1Q00623 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apoa1Q00623 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apoa1Q00623 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apoa1Q00623 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apoa1Q00623 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apoa1Q00623 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apoa1Q00623 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Apoa1Q00623 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apoa1Q00623 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apoa1Q00623 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apoa1Q00623 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apoa1Q00623 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apoa1Q00623 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apoa1Q00623 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apoa1Q00623 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Apoa1Q00623 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apoa1Q00623 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apoa1Q00623 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apoa1Q00623 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apoa1Q00623 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apoa1Q00623 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Apoa1Q00623 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Apoa1Q00623 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apoa1Q00623 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apoa1Q00623 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apoa1Q00623 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apoa1Q00623 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apoa1Q00623 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apoa1Q00623 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apoa1Q00623 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apoa1Q00623 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms