Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pax8Q00288 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pax8Q00288 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pax8Q00288 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pax8Q00288 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pax8Q00288 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pax8Q00288 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pax8Q00288 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pax8Q00288 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pax8Q00288 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Pax8Q00288 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pax8Q00288 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pax8Q00288 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pax8Q00288 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pax8Q00288 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pax8Q00288 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pax8Q00288 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pax8Q00288 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pax8Q00288 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pax8Q00288 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Pax8Q00288 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pax8Q00288 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pax8Q00288 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pax8Q00288 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pax8Q00288 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pax8Q00288 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pax8Q00288 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pax8Q00288 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pax8Q00288 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pax8Q00288 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pax8Q00288 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pax8Q00288 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pax8Q00288 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pax8Q00288 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pax8Q00288 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Pax8Q00288 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pax8Q00288 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pax8Q00288 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pax8Q00288 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pax8Q00288 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pax8Q00288 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pax8Q00288 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pax8Q00288 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pax8Q00288 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pax8Q00288 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pax8Q00288 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pax8Q00288 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pax8Q00288 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pax8Q00288 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pax8Q00288 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pax8Q00288 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pax8Q00288 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pax8Q00288 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pax8Q00288 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pax8Q00288 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pax8Q00288 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pax8Q00288 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pax8Q00288 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pax8Q00288 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pax8Q00288 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pax8Q00288 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pax8Q00288 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pax8Q00288 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pax8Q00288 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pax8Q00288 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pax8Q00288 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pax8Q00288 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pax8Q00288 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pax8Q00288 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pax8Q00288 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pax8Q00288 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pax8Q00288 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pax8Q00288 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pax8Q00288 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pax8Q00288 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pax8Q00288 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pax8Q00288 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pax8Q00288 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pax8Q00288 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pax8Q00288 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pax8Q00288 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pax8Q00288 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pax8Q00288 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pax8Q00288 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pax8Q00288 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pax8Q00288 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pax8Q00288 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pax8Q00288 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pax8Q00288 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pax8Q00288 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pax8Q00288 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pax8Q00288 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pax8Q00288 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pax8Q00288 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pax8Q00288 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pax8Q00288 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pax8Q00288 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pax8Q00288 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pax8Q00288 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pax8Q00288 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms