Protein–RNA interactions for Protein: P97801

Smn1, Survival motor neuron protein, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smn1P97801 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smn1P97801 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smn1P97801 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smn1P97801 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smn1P97801 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smn1P97801 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smn1P97801 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smn1P97801 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smn1P97801 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smn1P97801 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smn1P97801 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smn1P97801 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smn1P97801 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smn1P97801 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smn1P97801 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smn1P97801 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smn1P97801 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smn1P97801 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smn1P97801 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smn1P97801 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smn1P97801 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smn1P97801 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smn1P97801 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smn1P97801 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Smn1P97801 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smn1P97801 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smn1P97801 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Smn1P97801 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smn1P97801 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smn1P97801 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smn1P97801 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smn1P97801 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smn1P97801 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smn1P97801 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smn1P97801 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smn1P97801 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smn1P97801 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smn1P97801 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smn1P97801 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smn1P97801 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smn1P97801 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smn1P97801 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smn1P97801 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smn1P97801 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smn1P97801 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smn1P97801 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smn1P97801 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smn1P97801 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smn1P97801 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smn1P97801 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smn1P97801 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smn1P97801 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smn1P97801 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smn1P97801 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smn1P97801 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smn1P97801 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smn1P97801 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Smn1P97801 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smn1P97801 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smn1P97801 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smn1P97801 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smn1P97801 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smn1P97801 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smn1P97801 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smn1P97801 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smn1P97801 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smn1P97801 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smn1P97801 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smn1P97801 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smn1P97801 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smn1P97801 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smn1P97801 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smn1P97801 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smn1P97801 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smn1P97801 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smn1P97801 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smn1P97801 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Smn1P97801 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smn1P97801 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smn1P97801 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smn1P97801 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smn1P97801 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smn1P97801 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smn1P97801 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smn1P97801 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smn1P97801 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smn1P97801 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smn1P97801 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smn1P97801 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smn1P97801 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smn1P97801 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smn1P97801 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smn1P97801 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Smn1P97801 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smn1P97801 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smn1P97801 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smn1P97801 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Smn1P97801 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Smn1P97801 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smn1P97801 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms