Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smarcc1P97496 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smarcc1P97496 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smarcc1P97496 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smarcc1P97496 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smarcc1P97496 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smarcc1P97496 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smarcc1P97496 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smarcc1P97496 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smarcc1P97496 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smarcc1P97496 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smarcc1P97496 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smarcc1P97496 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smarcc1P97496 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smarcc1P97496 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smarcc1P97496 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smarcc1P97496 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smarcc1P97496 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smarcc1P97496 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smarcc1P97496 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smarcc1P97496 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smarcc1P97496 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smarcc1P97496 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smarcc1P97496 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Smarcc1P97496 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Smarcc1P97496 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Smarcc1P97496 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Smarcc1P97496 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smarcc1P97496 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smarcc1P97496 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smarcc1P97496 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smarcc1P97496 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smarcc1P97496 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smarcc1P97496 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smarcc1P97496 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smarcc1P97496 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smarcc1P97496 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smarcc1P97496 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smarcc1P97496 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Smarcc1P97496 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smarcc1P97496 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smarcc1P97496 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Smarcc1P97496 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smarcc1P97496 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smarcc1P97496 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smarcc1P97496 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smarcc1P97496 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smarcc1P97496 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smarcc1P97496 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smarcc1P97496 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smarcc1P97496 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smarcc1P97496 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smarcc1P97496 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smarcc1P97496 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smarcc1P97496 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smarcc1P97496 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Smarcc1P97496 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smarcc1P97496 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smarcc1P97496 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smarcc1P97496 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smarcc1P97496 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smarcc1P97496 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smarcc1P97496 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smarcc1P97496 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smarcc1P97496 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Smarcc1P97496 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smarcc1P97496 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smarcc1P97496 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smarcc1P97496 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smarcc1P97496 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smarcc1P97496 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smarcc1P97496 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smarcc1P97496 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smarcc1P97496 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Smarcc1P97496 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smarcc1P97496 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smarcc1P97496 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smarcc1P97496 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smarcc1P97496 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smarcc1P97496 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smarcc1P97496 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smarcc1P97496 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smarcc1P97496 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smarcc1P97496 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smarcc1P97496 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smarcc1P97496 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smarcc1P97496 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smarcc1P97496 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smarcc1P97496 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smarcc1P97496 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smarcc1P97496 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smarcc1P97496 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smarcc1P97496 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smarcc1P97496 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smarcc1P97496 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smarcc1P97496 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smarcc1P97496 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smarcc1P97496 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smarcc1P97496 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smarcc1P97496 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms