Protein–RNA interactions for Protein: P97370

Atp1b3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b3P97370 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp1b3P97370 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp1b3P97370 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp1b3P97370 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp1b3P97370 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp1b3P97370 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp1b3P97370 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp1b3P97370 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp1b3P97370 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp1b3P97370 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp1b3P97370 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp1b3P97370 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp1b3P97370 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp1b3P97370 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp1b3P97370 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp1b3P97370 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp1b3P97370 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp1b3P97370 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp1b3P97370 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp1b3P97370 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp1b3P97370 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp1b3P97370 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp1b3P97370 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp1b3P97370 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp1b3P97370 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp1b3P97370 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp1b3P97370 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp1b3P97370 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp1b3P97370 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp1b3P97370 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp1b3P97370 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp1b3P97370 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp1b3P97370 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp1b3P97370 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp1b3P97370 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp1b3P97370 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp1b3P97370 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp1b3P97370 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp1b3P97370 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp1b3P97370 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp1b3P97370 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp1b3P97370 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp1b3P97370 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp1b3P97370 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp1b3P97370 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp1b3P97370 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp1b3P97370 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp1b3P97370 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp1b3P97370 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp1b3P97370 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp1b3P97370 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp1b3P97370 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp1b3P97370 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp1b3P97370 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp1b3P97370 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp1b3P97370 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp1b3P97370 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp1b3P97370 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp1b3P97370 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp1b3P97370 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp1b3P97370 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp1b3P97370 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp1b3P97370 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp1b3P97370 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp1b3P97370 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp1b3P97370 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp1b3P97370 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp1b3P97370 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp1b3P97370 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp1b3P97370 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp1b3P97370 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp1b3P97370 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp1b3P97370 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp1b3P97370 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp1b3P97370 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp1b3P97370 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp1b3P97370 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp1b3P97370 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp1b3P97370 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp1b3P97370 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp1b3P97370 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp1b3P97370 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp1b3P97370 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp1b3P97370 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp1b3P97370 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp1b3P97370 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp1b3P97370 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp1b3P97370 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp1b3P97370 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp1b3P97370 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp1b3P97370 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp1b3P97370 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp1b3P97370 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp1b3P97370 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp1b3P97370 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp1b3P97370 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp1b3P97370 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp1b3P97370 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp1b3P97370 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp1b3P97370 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms