Protein–RNA interactions for Protein: P97348

Rhod, Rho-related GTP-binding protein RhoD, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhodP97348 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhodP97348 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhodP97348 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhodP97348 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RhodP97348 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RhodP97348 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RhodP97348 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RhodP97348 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RhodP97348 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RhodP97348 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RhodP97348 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RhodP97348 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
RhodP97348 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RhodP97348 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RhodP97348 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RhodP97348 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RhodP97348 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RhodP97348 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RhodP97348 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RhodP97348 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RhodP97348 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RhodP97348 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RhodP97348 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RhodP97348 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RhodP97348 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RhodP97348 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RhodP97348 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RhodP97348 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RhodP97348 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RhodP97348 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RhodP97348 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RhodP97348 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RhodP97348 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RhodP97348 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RhodP97348 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RhodP97348 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RhodP97348 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RhodP97348 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RhodP97348 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RhodP97348 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RhodP97348 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RhodP97348 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RhodP97348 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RhodP97348 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RhodP97348 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RhodP97348 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RhodP97348 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RhodP97348 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RhodP97348 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RhodP97348 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RhodP97348 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RhodP97348 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RhodP97348 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RhodP97348 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RhodP97348 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RhodP97348 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RhodP97348 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RhodP97348 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RhodP97348 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RhodP97348 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RhodP97348 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RhodP97348 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RhodP97348 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RhodP97348 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RhodP97348 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RhodP97348 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RhodP97348 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RhodP97348 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RhodP97348 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RhodP97348 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RhodP97348 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RhodP97348 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RhodP97348 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RhodP97348 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RhodP97348 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RhodP97348 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RhodP97348 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RhodP97348 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RhodP97348 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RhodP97348 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RhodP97348 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RhodP97348 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RhodP97348 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RhodP97348 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RhodP97348 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RhodP97348 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RhodP97348 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RhodP97348 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RhodP97348 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RhodP97348 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RhodP97348 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RhodP97348 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RhodP97348 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RhodP97348 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RhodP97348 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RhodP97348 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RhodP97348 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RhodP97348 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RhodP97348 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RhodP97348 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.5 ms