Protein–RNA interactions for Protein: P81269

Atf1, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf1P81269 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf1P81269 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf1P81269 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atf1P81269 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atf1P81269 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atf1P81269 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atf1P81269 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atf1P81269 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atf1P81269 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atf1P81269 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atf1P81269 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atf1P81269 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atf1P81269 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atf1P81269 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf1P81269 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf1P81269 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf1P81269 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf1P81269 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf1P81269 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf1P81269 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf1P81269 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf1P81269 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf1P81269 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf1P81269 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf1P81269 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf1P81269 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf1P81269 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf1P81269 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf1P81269 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf1P81269 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf1P81269 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf1P81269 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf1P81269 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf1P81269 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf1P81269 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf1P81269 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf1P81269 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf1P81269 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf1P81269 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf1P81269 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf1P81269 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf1P81269 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf1P81269 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf1P81269 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf1P81269 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf1P81269 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf1P81269 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf1P81269 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf1P81269 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf1P81269 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf1P81269 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf1P81269 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf1P81269 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf1P81269 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf1P81269 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf1P81269 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf1P81269 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf1P81269 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf1P81269 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf1P81269 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf1P81269 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf1P81269 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Atf1P81269 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf1P81269 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf1P81269 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf1P81269 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf1P81269 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf1P81269 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf1P81269 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf1P81269 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf1P81269 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf1P81269 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf1P81269 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf1P81269 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf1P81269 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf1P81269 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf1P81269 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf1P81269 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf1P81269 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf1P81269 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf1P81269 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf1P81269 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf1P81269 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf1P81269 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf1P81269 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf1P81269 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf1P81269 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf1P81269 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf1P81269 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf1P81269 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf1P81269 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf1P81269 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf1P81269 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf1P81269 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf1P81269 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf1P81269 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf1P81269 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf1P81269 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf1P81269 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf1P81269 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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