Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Otx1P80205 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Otx1P80205 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Otx1P80205 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Otx1P80205 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Otx1P80205 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Otx1P80205 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Otx1P80205 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Otx1P80205 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Otx1P80205 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Otx1P80205 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otx1P80205 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otx1P80205 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otx1P80205 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otx1P80205 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otx1P80205 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otx1P80205 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otx1P80205 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otx1P80205 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otx1P80205 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otx1P80205 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otx1P80205 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otx1P80205 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otx1P80205 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otx1P80205 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otx1P80205 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otx1P80205 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otx1P80205 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otx1P80205 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otx1P80205 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otx1P80205 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otx1P80205 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otx1P80205 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otx1P80205 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otx1P80205 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otx1P80205 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otx1P80205 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otx1P80205 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Otx1P80205 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otx1P80205 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otx1P80205 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otx1P80205 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otx1P80205 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otx1P80205 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otx1P80205 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otx1P80205 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otx1P80205 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otx1P80205 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otx1P80205 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otx1P80205 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otx1P80205 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otx1P80205 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otx1P80205 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otx1P80205 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otx1P80205 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Otx1P80205 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otx1P80205 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otx1P80205 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otx1P80205 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otx1P80205 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otx1P80205 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otx1P80205 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otx1P80205 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otx1P80205 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otx1P80205 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otx1P80205 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otx1P80205 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otx1P80205 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otx1P80205 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Otx1P80205 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Otx1P80205 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Otx1P80205 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Otx1P80205 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Otx1P80205 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Otx1P80205 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Otx1P80205 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Otx1P80205 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otx1P80205 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otx1P80205 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otx1P80205 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otx1P80205 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otx1P80205 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otx1P80205 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Otx1P80205 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otx1P80205 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otx1P80205 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otx1P80205 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otx1P80205 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otx1P80205 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otx1P80205 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otx1P80205 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otx1P80205 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otx1P80205 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otx1P80205 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otx1P80205 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otx1P80205 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otx1P80205 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otx1P80205 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otx1P80205 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otx1P80205 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms