Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gfi1P70338 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gfi1P70338 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gfi1P70338 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gfi1P70338 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Gfi1P70338 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gfi1P70338 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gfi1P70338 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gfi1P70338 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gfi1P70338 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gfi1P70338 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gfi1P70338 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gfi1P70338 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gfi1P70338 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gfi1P70338 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gfi1P70338 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gfi1P70338 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gfi1P70338 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Gfi1P70338 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gfi1P70338 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gfi1P70338 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Gfi1P70338 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gfi1P70338 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gfi1P70338 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gfi1P70338 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Gfi1P70338 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gfi1P70338 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gfi1P70338 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gfi1P70338 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gfi1P70338 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gfi1P70338 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gfi1P70338 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gfi1P70338 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gfi1P70338 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gfi1P70338 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gfi1P70338 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gfi1P70338 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Gfi1P70338 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gfi1P70338 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gfi1P70338 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gfi1P70338 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gfi1P70338 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gfi1P70338 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gfi1P70338 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gfi1P70338 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gfi1P70338 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gfi1P70338 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gfi1P70338 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gfi1P70338 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gfi1P70338 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gfi1P70338 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gfi1P70338 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gfi1P70338 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gfi1P70338 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gfi1P70338 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gfi1P70338 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gfi1P70338 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gfi1P70338 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Gfi1P70338 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gfi1P70338 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gfi1P70338 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gfi1P70338 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gfi1P70338 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gfi1P70338 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gfi1P70338 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gfi1P70338 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gfi1P70338 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gfi1P70338 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gfi1P70338 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gfi1P70338 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Gfi1P70338 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gfi1P70338 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gfi1P70338 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gfi1P70338 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gfi1P70338 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gfi1P70338 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gfi1P70338 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gfi1P70338 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gfi1P70338 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gfi1P70338 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gfi1P70338 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gfi1P70338 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gfi1P70338 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gfi1P70338 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gfi1P70338 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gfi1P70338 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gfi1P70338 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gfi1P70338 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gfi1P70338 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gfi1P70338 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gfi1P70338 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gfi1P70338 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gfi1P70338 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gfi1P70338 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gfi1P70338 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gfi1P70338 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gfi1P70338 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gfi1P70338 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gfi1P70338 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gfi1P70338 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms