Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chl1P70232 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chl1P70232 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chl1P70232 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Chl1P70232 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chl1P70232 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chl1P70232 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chl1P70232 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chl1P70232 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chl1P70232 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chl1P70232 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chl1P70232 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chl1P70232 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chl1P70232 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chl1P70232 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chl1P70232 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chl1P70232 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chl1P70232 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chl1P70232 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chl1P70232 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chl1P70232 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chl1P70232 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chl1P70232 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chl1P70232 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chl1P70232 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chl1P70232 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chl1P70232 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chl1P70232 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chl1P70232 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Chl1P70232 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Chl1P70232 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chl1P70232 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chl1P70232 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chl1P70232 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chl1P70232 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chl1P70232 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Chl1P70232 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chl1P70232 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chl1P70232 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Chl1P70232 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Chl1P70232 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Chl1P70232 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chl1P70232 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Chl1P70232 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chl1P70232 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chl1P70232 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chl1P70232 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chl1P70232 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chl1P70232 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chl1P70232 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chl1P70232 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chl1P70232 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chl1P70232 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chl1P70232 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chl1P70232 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chl1P70232 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chl1P70232 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chl1P70232 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Chl1P70232 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Chl1P70232 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chl1P70232 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chl1P70232 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Chl1P70232 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chl1P70232 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chl1P70232 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chl1P70232 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chl1P70232 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chl1P70232 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Chl1P70232 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chl1P70232 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Chl1P70232 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chl1P70232 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chl1P70232 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chl1P70232 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Chl1P70232 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chl1P70232 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chl1P70232 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chl1P70232 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chl1P70232 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chl1P70232 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chl1P70232 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Chl1P70232 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chl1P70232 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Chl1P70232 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chl1P70232 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chl1P70232 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chl1P70232 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chl1P70232 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chl1P70232 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chl1P70232 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chl1P70232 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Chl1P70232 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chl1P70232 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chl1P70232 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chl1P70232 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chl1P70232 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chl1P70232 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chl1P70232 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chl1P70232 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chl1P70232 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms