Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxd13P70217 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxd13P70217 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxd13P70217 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxd13P70217 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxd13P70217 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxd13P70217 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxd13P70217 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxd13P70217 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxd13P70217 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxd13P70217 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxd13P70217 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxd13P70217 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxd13P70217 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxd13P70217 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxd13P70217 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxd13P70217 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxd13P70217 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxd13P70217 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxd13P70217 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxd13P70217 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxd13P70217 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxd13P70217 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxd13P70217 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxd13P70217 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxd13P70217 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxd13P70217 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxd13P70217 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxd13P70217 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxd13P70217 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxd13P70217 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxd13P70217 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxd13P70217 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxd13P70217 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxd13P70217 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxd13P70217 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxd13P70217 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxd13P70217 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxd13P70217 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxd13P70217 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxd13P70217 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxd13P70217 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxd13P70217 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxd13P70217 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxd13P70217 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxd13P70217 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxd13P70217 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxd13P70217 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxd13P70217 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxd13P70217 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxd13P70217 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxd13P70217 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxd13P70217 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxd13P70217 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxd13P70217 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxd13P70217 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxd13P70217 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxd13P70217 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxd13P70217 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxd13P70217 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxd13P70217 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxd13P70217 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxd13P70217 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxd13P70217 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxd13P70217 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxd13P70217 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxd13P70217 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxd13P70217 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxd13P70217 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxd13P70217 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxd13P70217 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxd13P70217 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxd13P70217 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxd13P70217 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxd13P70217 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxd13P70217 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxd13P70217 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxd13P70217 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxd13P70217 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxd13P70217 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Hoxd13P70217 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Hoxd13P70217 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Hoxd13P70217 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Hoxd13P70217 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxd13P70217 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxd13P70217 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxd13P70217 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxd13P70217 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxd13P70217 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxd13P70217 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxd13P70217 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxd13P70217 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxd13P70217 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Hoxd13P70217 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxd13P70217 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Hoxd13P70217 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Hoxd13P70217 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxd13P70217 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxd13P70217 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxd13P70217 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms