Protein–RNA interactions for Protein: P70196

Traf6, TNF receptor-associated factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf6P70196 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Traf6P70196 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Traf6P70196 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Traf6P70196 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Traf6P70196 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Traf6P70196 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Traf6P70196 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Traf6P70196 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Traf6P70196 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Traf6P70196 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Traf6P70196 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Traf6P70196 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Traf6P70196 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Traf6P70196 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Traf6P70196 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Traf6P70196 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Traf6P70196 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Traf6P70196 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Traf6P70196 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Traf6P70196 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Traf6P70196 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Traf6P70196 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Traf6P70196 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf6P70196 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf6P70196 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf6P70196 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf6P70196 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf6P70196 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf6P70196 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf6P70196 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf6P70196 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf6P70196 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf6P70196 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf6P70196 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf6P70196 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf6P70196 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf6P70196 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf6P70196 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf6P70196 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf6P70196 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf6P70196 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf6P70196 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf6P70196 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf6P70196 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf6P70196 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf6P70196 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf6P70196 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf6P70196 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf6P70196 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf6P70196 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf6P70196 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf6P70196 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf6P70196 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf6P70196 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf6P70196 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf6P70196 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf6P70196 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf6P70196 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf6P70196 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf6P70196 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf6P70196 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf6P70196 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf6P70196 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf6P70196 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf6P70196 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf6P70196 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf6P70196 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf6P70196 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf6P70196 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf6P70196 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf6P70196 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf6P70196 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf6P70196 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf6P70196 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf6P70196 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf6P70196 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf6P70196 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf6P70196 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf6P70196 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf6P70196 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf6P70196 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf6P70196 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf6P70196 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf6P70196 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf6P70196 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf6P70196 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf6P70196 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf6P70196 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf6P70196 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf6P70196 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf6P70196 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf6P70196 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf6P70196 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf6P70196 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf6P70196 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf6P70196 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf6P70196 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf6P70196 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf6P70196 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf6P70196 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms