Protein–RNA interactions for Protein: P70170

Abcc9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc9P70170 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC37.71■■■■□ 3.63
Abcc9P70170 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
Abcc9P70170 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Abcc9P70170 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Abcc9P70170 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Abcc9P70170 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Abcc9P70170 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
Abcc9P70170 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Abcc9P70170 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Abcc9P70170 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC37.7■■■■□ 3.63
Abcc9P70170 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Abcc9P70170 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC37.7■■■■□ 3.63
Abcc9P70170 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Abcc9P70170 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Abcc9P70170 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
Abcc9P70170 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
Abcc9P70170 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
Abcc9P70170 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Abcc9P70170 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Abcc9P70170 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Abcc9P70170 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Abcc9P70170 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Abcc9P70170 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Abcc9P70170 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Abcc9P70170 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC37.68■■■■□ 3.62
Abcc9P70170 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Abcc9P70170 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Abcc9P70170 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Abcc9P70170 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
Abcc9P70170 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Abcc9P70170 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Abcc9P70170 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Abcc9P70170 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Abcc9P70170 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Abcc9P70170 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Abcc9P70170 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
Abcc9P70170 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Abcc9P70170 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC37.66■■■■□ 3.62
Abcc9P70170 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Abcc9P70170 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Abcc9P70170 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC37.66■■■■□ 3.62
Abcc9P70170 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Abcc9P70170 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
Abcc9P70170 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Abcc9P70170 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC37.65■■■■□ 3.62
Abcc9P70170 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Abcc9P70170 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Abcc9P70170 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Abcc9P70170 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC37.64■■■■□ 3.62
Abcc9P70170 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Abcc9P70170 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Abcc9P70170 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Abcc9P70170 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Abcc9P70170 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.62
Abcc9P70170 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.62
Abcc9P70170 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
Abcc9P70170 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC37.63■■■■□ 3.61
Abcc9P70170 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
Abcc9P70170 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
Abcc9P70170 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
Abcc9P70170 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
Abcc9P70170 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Abcc9P70170 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC37.62■■■■□ 3.61
Abcc9P70170 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Abcc9P70170 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
Abcc9P70170 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
Abcc9P70170 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
Abcc9P70170 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Abcc9P70170 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Abcc9P70170 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Abcc9P70170 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Abcc9P70170 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC37.61■■■■□ 3.61
Abcc9P70170 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Abcc9P70170 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Abcc9P70170 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC37.6■■■■□ 3.61
Abcc9P70170 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Abcc9P70170 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Abcc9P70170 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Abcc9P70170 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Abcc9P70170 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Abcc9P70170 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Abcc9P70170 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC37.59■■■■□ 3.61
Abcc9P70170 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
Abcc9P70170 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
Abcc9P70170 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Abcc9P70170 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Abcc9P70170 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
Abcc9P70170 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
Abcc9P70170 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC37.58■■■■□ 3.61
Abcc9P70170 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
Abcc9P70170 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Abcc9P70170 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC37.57■■■■□ 3.61
Abcc9P70170 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC37.57■■■■□ 3.61
Abcc9P70170 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
Abcc9P70170 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
Abcc9P70170 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
Abcc9P70170 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
Abcc9P70170 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Abcc9P70170 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Abcc9P70170 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms