Protein–RNA interactions for Protein: P63089

Ptn, Pleiotrophin, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtnP63089 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtnP63089 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtnP63089 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtnP63089 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtnP63089 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtnP63089 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtnP63089 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtnP63089 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtnP63089 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtnP63089 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtnP63089 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtnP63089 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtnP63089 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PtnP63089 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtnP63089 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtnP63089 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtnP63089 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtnP63089 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtnP63089 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtnP63089 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtnP63089 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtnP63089 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtnP63089 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtnP63089 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtnP63089 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtnP63089 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtnP63089 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtnP63089 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtnP63089 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtnP63089 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtnP63089 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtnP63089 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtnP63089 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtnP63089 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtnP63089 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtnP63089 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtnP63089 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtnP63089 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtnP63089 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtnP63089 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtnP63089 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtnP63089 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtnP63089 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtnP63089 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtnP63089 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtnP63089 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtnP63089 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtnP63089 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtnP63089 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtnP63089 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtnP63089 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtnP63089 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PtnP63089 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtnP63089 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtnP63089 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtnP63089 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtnP63089 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtnP63089 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtnP63089 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtnP63089 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PtnP63089 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtnP63089 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtnP63089 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtnP63089 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtnP63089 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtnP63089 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtnP63089 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtnP63089 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtnP63089 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtnP63089 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtnP63089 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtnP63089 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtnP63089 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtnP63089 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtnP63089 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtnP63089 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtnP63089 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtnP63089 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtnP63089 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PtnP63089 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtnP63089 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtnP63089 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PtnP63089 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtnP63089 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtnP63089 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtnP63089 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtnP63089 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtnP63089 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtnP63089 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtnP63089 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtnP63089 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PtnP63089 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtnP63089 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PtnP63089 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtnP63089 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtnP63089 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtnP63089 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtnP63089 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtnP63089 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtnP63089 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms