Protein–RNA interactions for Protein: P62984

Uba52, Ubiquitin-60S ribosomal protein L40, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uba52P62984 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Uba52P62984 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Uba52P62984 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Uba52P62984 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Uba52P62984 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Uba52P62984 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Uba52P62984 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Uba52P62984 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Uba52P62984 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Uba52P62984 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uba52P62984 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uba52P62984 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uba52P62984 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uba52P62984 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uba52P62984 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uba52P62984 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uba52P62984 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uba52P62984 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uba52P62984 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uba52P62984 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Uba52P62984 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uba52P62984 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uba52P62984 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uba52P62984 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uba52P62984 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uba52P62984 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uba52P62984 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uba52P62984 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uba52P62984 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uba52P62984 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uba52P62984 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uba52P62984 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uba52P62984 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uba52P62984 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Uba52P62984 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uba52P62984 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uba52P62984 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uba52P62984 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uba52P62984 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uba52P62984 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uba52P62984 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uba52P62984 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uba52P62984 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uba52P62984 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uba52P62984 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uba52P62984 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uba52P62984 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uba52P62984 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uba52P62984 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uba52P62984 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uba52P62984 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uba52P62984 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uba52P62984 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uba52P62984 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uba52P62984 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uba52P62984 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uba52P62984 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uba52P62984 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uba52P62984 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uba52P62984 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uba52P62984 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uba52P62984 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uba52P62984 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Uba52P62984 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uba52P62984 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uba52P62984 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uba52P62984 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uba52P62984 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uba52P62984 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uba52P62984 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uba52P62984 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uba52P62984 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uba52P62984 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uba52P62984 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uba52P62984 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uba52P62984 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uba52P62984 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uba52P62984 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uba52P62984 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uba52P62984 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uba52P62984 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uba52P62984 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uba52P62984 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uba52P62984 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Uba52P62984 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uba52P62984 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uba52P62984 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uba52P62984 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uba52P62984 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uba52P62984 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uba52P62984 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uba52P62984 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uba52P62984 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uba52P62984 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Uba52P62984 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uba52P62984 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uba52P62984 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uba52P62984 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uba52P62984 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uba52P62984 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms