Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps3P62908 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps3P62908 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps3P62908 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps3P62908 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps3P62908 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps3P62908 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps3P62908 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps3P62908 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps3P62908 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps3P62908 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps3P62908 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps3P62908 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps3P62908 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rps3P62908 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rps3P62908 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rps3P62908 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rps3P62908 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rps3P62908 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps3P62908 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps3P62908 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps3P62908 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps3P62908 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps3P62908 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps3P62908 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps3P62908 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps3P62908 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps3P62908 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps3P62908 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps3P62908 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps3P62908 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps3P62908 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps3P62908 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps3P62908 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps3P62908 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps3P62908 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps3P62908 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps3P62908 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps3P62908 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps3P62908 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps3P62908 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps3P62908 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps3P62908 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps3P62908 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps3P62908 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps3P62908 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps3P62908 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps3P62908 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps3P62908 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps3P62908 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps3P62908 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps3P62908 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps3P62908 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps3P62908 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps3P62908 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps3P62908 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps3P62908 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps3P62908 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps3P62908 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps3P62908 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps3P62908 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps3P62908 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps3P62908 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps3P62908 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps3P62908 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps3P62908 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps3P62908 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps3P62908 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps3P62908 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps3P62908 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps3P62908 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps3P62908 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps3P62908 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps3P62908 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps3P62908 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps3P62908 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps3P62908 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps3P62908 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps3P62908 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps3P62908 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps3P62908 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps3P62908 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps3P62908 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps3P62908 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps3P62908 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps3P62908 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps3P62908 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps3P62908 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps3P62908 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps3P62908 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps3P62908 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps3P62908 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps3P62908 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps3P62908 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps3P62908 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps3P62908 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps3P62908 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps3P62908 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps3P62908 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps3P62908 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms