Protein–RNA interactions for Protein: P62874

Gnb1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnb1P62874 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gnb1P62874 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gnb1P62874 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gnb1P62874 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gnb1P62874 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gnb1P62874 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gnb1P62874 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gnb1P62874 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gnb1P62874 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gnb1P62874 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gnb1P62874 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gnb1P62874 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gnb1P62874 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gnb1P62874 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gnb1P62874 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gnb1P62874 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gnb1P62874 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gnb1P62874 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gnb1P62874 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gnb1P62874 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gnb1P62874 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gnb1P62874 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gnb1P62874 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gnb1P62874 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gnb1P62874 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gnb1P62874 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms