Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
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Rab3cP62823 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab3cP62823 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab3cP62823 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab3cP62823 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab3cP62823 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab3cP62823 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Rab3cP62823 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab3cP62823 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab3cP62823 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab3cP62823 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab3cP62823 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab3cP62823 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab3cP62823 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab3cP62823 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab3cP62823 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab3cP62823 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab3cP62823 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab3cP62823 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Rab3cP62823 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab3cP62823 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab3cP62823 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab3cP62823 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab3cP62823 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Rab3cP62823 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab3cP62823 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab3cP62823 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab3cP62823 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab3cP62823 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Rab3cP62823 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Rab3cP62823 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Rab3cP62823 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Rab3cP62823 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Rab3cP62823 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Rab3cP62823 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab3cP62823 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab3cP62823 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab3cP62823 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab3cP62823 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab3cP62823 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab3cP62823 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab3cP62823 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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