Protein–RNA interactions for Protein: P62080

Tspan5, Tetraspanin-5, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan5P62080 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tspan5P62080 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tspan5P62080 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tspan5P62080 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tspan5P62080 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tspan5P62080 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tspan5P62080 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tspan5P62080 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tspan5P62080 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tspan5P62080 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tspan5P62080 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tspan5P62080 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tspan5P62080 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tspan5P62080 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tspan5P62080 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tspan5P62080 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tspan5P62080 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspan5P62080 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspan5P62080 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspan5P62080 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspan5P62080 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspan5P62080 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspan5P62080 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspan5P62080 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspan5P62080 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspan5P62080 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspan5P62080 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspan5P62080 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspan5P62080 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspan5P62080 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspan5P62080 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspan5P62080 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspan5P62080 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspan5P62080 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tspan5P62080 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tspan5P62080 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tspan5P62080 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tspan5P62080 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tspan5P62080 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tspan5P62080 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tspan5P62080 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tspan5P62080 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tspan5P62080 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tspan5P62080 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tspan5P62080 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tspan5P62080 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tspan5P62080 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tspan5P62080 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tspan5P62080 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tspan5P62080 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tspan5P62080 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tspan5P62080 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tspan5P62080 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tspan5P62080 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tspan5P62080 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tspan5P62080 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tspan5P62080 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tspan5P62080 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tspan5P62080 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tspan5P62080 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tspan5P62080 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tspan5P62080 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tspan5P62080 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tspan5P62080 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tspan5P62080 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tspan5P62080 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tspan5P62080 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tspan5P62080 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tspan5P62080 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tspan5P62080 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tspan5P62080 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tspan5P62080 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tspan5P62080 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tspan5P62080 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tspan5P62080 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tspan5P62080 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tspan5P62080 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tspan5P62080 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tspan5P62080 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tspan5P62080 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tspan5P62080 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tspan5P62080 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tspan5P62080 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tspan5P62080 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tspan5P62080 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tspan5P62080 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tspan5P62080 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tspan5P62080 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tspan5P62080 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tspan5P62080 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tspan5P62080 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tspan5P62080 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tspan5P62080 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tspan5P62080 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tspan5P62080 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tspan5P62080 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan5P62080 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan5P62080 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan5P62080 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan5P62080 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms