Protein–RNA interactions for Protein: P61407

Tdrd6, Tudor domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 2,134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd6P61407 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tdrd6P61407 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tdrd6P61407 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tdrd6P61407 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tdrd6P61407 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tdrd6P61407 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tdrd6P61407 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tdrd6P61407 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tdrd6P61407 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tdrd6P61407 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tdrd6P61407 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tdrd6P61407 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tdrd6P61407 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tdrd6P61407 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tdrd6P61407 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tdrd6P61407 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tdrd6P61407 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tdrd6P61407 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tdrd6P61407 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tdrd6P61407 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tdrd6P61407 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tdrd6P61407 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tdrd6P61407 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tdrd6P61407 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tdrd6P61407 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tdrd6P61407 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tdrd6P61407 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tdrd6P61407 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tdrd6P61407 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tdrd6P61407 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tdrd6P61407 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tdrd6P61407 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tdrd6P61407 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tdrd6P61407 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tdrd6P61407 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tdrd6P61407 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tdrd6P61407 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tdrd6P61407 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tdrd6P61407 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tdrd6P61407 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tdrd6P61407 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tdrd6P61407 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tdrd6P61407 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tdrd6P61407 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tdrd6P61407 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tdrd6P61407 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tdrd6P61407 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tdrd6P61407 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tdrd6P61407 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tdrd6P61407 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tdrd6P61407 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tdrd6P61407 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Tdrd6P61407 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tdrd6P61407 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tdrd6P61407 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tdrd6P61407 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tdrd6P61407 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tdrd6P61407 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tdrd6P61407 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tdrd6P61407 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tdrd6P61407 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tdrd6P61407 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tdrd6P61407 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tdrd6P61407 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tdrd6P61407 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tdrd6P61407 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tdrd6P61407 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tdrd6P61407 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tdrd6P61407 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tdrd6P61407 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tdrd6P61407 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tdrd6P61407 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tdrd6P61407 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tdrd6P61407 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tdrd6P61407 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tdrd6P61407 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tdrd6P61407 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tdrd6P61407 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tdrd6P61407 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tdrd6P61407 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tdrd6P61407 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tdrd6P61407 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tdrd6P61407 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tdrd6P61407 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tdrd6P61407 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tdrd6P61407 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tdrd6P61407 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tdrd6P61407 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tdrd6P61407 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tdrd6P61407 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tdrd6P61407 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tdrd6P61407 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tdrd6P61407 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tdrd6P61407 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tdrd6P61407 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tdrd6P61407 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tdrd6P61407 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tdrd6P61407 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tdrd6P61407 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tdrd6P61407 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms