Protein–RNA interactions for Protein: P61222

Abce1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abce1P61222 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Abce1P61222 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Abce1P61222 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Abce1P61222 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Abce1P61222 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Abce1P61222 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Abce1P61222 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Abce1P61222 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Abce1P61222 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Abce1P61222 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Abce1P61222 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Abce1P61222 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Abce1P61222 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Abce1P61222 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Abce1P61222 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Abce1P61222 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Abce1P61222 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Abce1P61222 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Abce1P61222 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Abce1P61222 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Abce1P61222 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abce1P61222 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abce1P61222 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abce1P61222 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abce1P61222 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abce1P61222 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abce1P61222 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abce1P61222 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abce1P61222 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Abce1P61222 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Abce1P61222 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abce1P61222 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abce1P61222 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abce1P61222 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abce1P61222 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abce1P61222 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abce1P61222 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abce1P61222 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abce1P61222 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abce1P61222 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abce1P61222 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abce1P61222 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abce1P61222 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abce1P61222 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Abce1P61222 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Abce1P61222 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abce1P61222 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abce1P61222 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abce1P61222 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abce1P61222 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abce1P61222 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abce1P61222 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abce1P61222 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abce1P61222 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abce1P61222 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abce1P61222 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abce1P61222 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abce1P61222 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abce1P61222 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abce1P61222 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abce1P61222 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abce1P61222 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abce1P61222 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abce1P61222 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abce1P61222 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abce1P61222 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abce1P61222 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abce1P61222 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abce1P61222 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Abce1P61222 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Abce1P61222 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Abce1P61222 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Abce1P61222 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Abce1P61222 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Abce1P61222 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Abce1P61222 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Abce1P61222 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Abce1P61222 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Abce1P61222 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Abce1P61222 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Abce1P61222 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Abce1P61222 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Abce1P61222 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Abce1P61222 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Abce1P61222 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Abce1P61222 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Abce1P61222 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Abce1P61222 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Abce1P61222 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Abce1P61222 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Abce1P61222 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Abce1P61222 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Abce1P61222 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Abce1P61222 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Abce1P61222 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Abce1P61222 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Abce1P61222 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Abce1P61222 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Abce1P61222 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Abce1P61222 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms