Protein–RNA interactions for Protein: P61216

Taf13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf13P61216 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf13P61216 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf13P61216 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf13P61216 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf13P61216 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf13P61216 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf13P61216 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Taf13P61216 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms