Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppfia3P60469 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppfia3P60469 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppfia3P60469 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppfia3P60469 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppfia3P60469 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppfia3P60469 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppfia3P60469 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppfia3P60469 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppfia3P60469 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppfia3P60469 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppfia3P60469 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppfia3P60469 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppfia3P60469 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppfia3P60469 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppfia3P60469 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppfia3P60469 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppfia3P60469 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppfia3P60469 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppfia3P60469 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppfia3P60469 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppfia3P60469 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppfia3P60469 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppfia3P60469 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppfia3P60469 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppfia3P60469 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppfia3P60469 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppfia3P60469 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppfia3P60469 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppfia3P60469 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppfia3P60469 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppfia3P60469 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppfia3P60469 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppfia3P60469 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppfia3P60469 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppfia3P60469 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppfia3P60469 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppfia3P60469 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppfia3P60469 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppfia3P60469 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppfia3P60469 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppfia3P60469 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppfia3P60469 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppfia3P60469 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppfia3P60469 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppfia3P60469 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppfia3P60469 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppfia3P60469 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppfia3P60469 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppfia3P60469 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppfia3P60469 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppfia3P60469 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppfia3P60469 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppfia3P60469 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppfia3P60469 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppfia3P60469 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppfia3P60469 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppfia3P60469 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppfia3P60469 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppfia3P60469 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppfia3P60469 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppfia3P60469 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppfia3P60469 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppfia3P60469 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppfia3P60469 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppfia3P60469 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppfia3P60469 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppfia3P60469 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppfia3P60469 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppfia3P60469 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppfia3P60469 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppfia3P60469 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppfia3P60469 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppfia3P60469 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppfia3P60469 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppfia3P60469 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppfia3P60469 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppfia3P60469 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppfia3P60469 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppfia3P60469 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppfia3P60469 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppfia3P60469 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppfia3P60469 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppfia3P60469 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppfia3P60469 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppfia3P60469 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppfia3P60469 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppfia3P60469 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppfia3P60469 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppfia3P60469 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppfia3P60469 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppfia3P60469 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppfia3P60469 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppfia3P60469 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppfia3P60469 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppfia3P60469 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppfia3P60469 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ppfia3P60469 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ppfia3P60469 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ppfia3P60469 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms