Protein–RNA interactions for Protein: P59054

Csrnp1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp1P59054 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Csrnp1P59054 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Csrnp1P59054 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Csrnp1P59054 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Csrnp1P59054 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Csrnp1P59054 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Csrnp1P59054 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Csrnp1P59054 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Csrnp1P59054 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Csrnp1P59054 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Csrnp1P59054 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Csrnp1P59054 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Csrnp1P59054 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Csrnp1P59054 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Csrnp1P59054 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Csrnp1P59054 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Csrnp1P59054 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Csrnp1P59054 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Csrnp1P59054 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Csrnp1P59054 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Csrnp1P59054 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Csrnp1P59054 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Csrnp1P59054 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Csrnp1P59054 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Csrnp1P59054 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Csrnp1P59054 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Csrnp1P59054 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Csrnp1P59054 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Csrnp1P59054 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Csrnp1P59054 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Csrnp1P59054 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Csrnp1P59054 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Csrnp1P59054 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Csrnp1P59054 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Csrnp1P59054 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Csrnp1P59054 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Csrnp1P59054 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Csrnp1P59054 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Csrnp1P59054 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Csrnp1P59054 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Csrnp1P59054 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Csrnp1P59054 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Csrnp1P59054 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Csrnp1P59054 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Csrnp1P59054 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Csrnp1P59054 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Csrnp1P59054 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Csrnp1P59054 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Csrnp1P59054 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Csrnp1P59054 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Csrnp1P59054 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Csrnp1P59054 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Csrnp1P59054 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Csrnp1P59054 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Csrnp1P59054 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Csrnp1P59054 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Csrnp1P59054 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Csrnp1P59054 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Csrnp1P59054 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Csrnp1P59054 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Csrnp1P59054 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Csrnp1P59054 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Csrnp1P59054 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Csrnp1P59054 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Csrnp1P59054 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Csrnp1P59054 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Csrnp1P59054 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Csrnp1P59054 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Csrnp1P59054 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Csrnp1P59054 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Csrnp1P59054 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Csrnp1P59054 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Csrnp1P59054 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Csrnp1P59054 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Csrnp1P59054 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Csrnp1P59054 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Csrnp1P59054 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Csrnp1P59054 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Csrnp1P59054 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Csrnp1P59054 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Csrnp1P59054 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Csrnp1P59054 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Csrnp1P59054 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Csrnp1P59054 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Csrnp1P59054 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Csrnp1P59054 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Csrnp1P59054 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Csrnp1P59054 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Csrnp1P59054 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Csrnp1P59054 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Csrnp1P59054 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Csrnp1P59054 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Csrnp1P59054 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Csrnp1P59054 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Csrnp1P59054 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Csrnp1P59054 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Csrnp1P59054 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Csrnp1P59054 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Csrnp1P59054 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Csrnp1P59054 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms