Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Bace1P56818 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Bace1P56818 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bace1P56818 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bace1P56818 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bace1P56818 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bace1P56818 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bace1P56818 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bace1P56818 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Bace1P56818 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bace1P56818 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bace1P56818 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bace1P56818 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bace1P56818 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bace1P56818 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bace1P56818 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bace1P56818 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bace1P56818 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bace1P56818 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bace1P56818 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bace1P56818 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bace1P56818 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bace1P56818 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Bace1P56818 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bace1P56818 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bace1P56818 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bace1P56818 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bace1P56818 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bace1P56818 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bace1P56818 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Bace1P56818 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Bace1P56818 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Bace1P56818 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Bace1P56818 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Bace1P56818 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Bace1P56818 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Bace1P56818 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Bace1P56818 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Bace1P56818 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Bace1P56818 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bace1P56818 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bace1P56818 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bace1P56818 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bace1P56818 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bace1P56818 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bace1P56818 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bace1P56818 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Bace1P56818 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bace1P56818 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Bace1P56818 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bace1P56818 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bace1P56818 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bace1P56818 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bace1P56818 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bace1P56818 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bace1P56818 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bace1P56818 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bace1P56818 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bace1P56818 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bace1P56818 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bace1P56818 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bace1P56818 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bace1P56818 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bace1P56818 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bace1P56818 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Bace1P56818 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bace1P56818 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bace1P56818 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bace1P56818 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bace1P56818 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bace1P56818 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bace1P56818 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bace1P56818 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bace1P56818 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bace1P56818 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bace1P56818 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bace1P56818 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bace1P56818 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bace1P56818 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bace1P56818 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Bace1P56818 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bace1P56818 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bace1P56818 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bace1P56818 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bace1P56818 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bace1P56818 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bace1P56818 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bace1P56818 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bace1P56818 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bace1P56818 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bace1P56818 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bace1P56818 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bace1P56818 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bace1P56818 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bace1P56818 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bace1P56818 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bace1P56818 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bace1P56818 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bace1P56818 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Bace1P56818 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms