Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp5P56399 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp5P56399 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp5P56399 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp5P56399 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp5P56399 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp5P56399 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp5P56399 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp5P56399 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp5P56399 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp5P56399 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp5P56399 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp5P56399 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp5P56399 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp5P56399 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp5P56399 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp5P56399 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp5P56399 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp5P56399 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp5P56399 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp5P56399 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp5P56399 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp5P56399 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp5P56399 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp5P56399 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp5P56399 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp5P56399 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp5P56399 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp5P56399 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp5P56399 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp5P56399 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp5P56399 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp5P56399 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp5P56399 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp5P56399 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp5P56399 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp5P56399 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp5P56399 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp5P56399 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp5P56399 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp5P56399 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp5P56399 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp5P56399 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp5P56399 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp5P56399 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp5P56399 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp5P56399 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp5P56399 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp5P56399 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp5P56399 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp5P56399 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp5P56399 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp5P56399 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp5P56399 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp5P56399 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp5P56399 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp5P56399 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp5P56399 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp5P56399 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp5P56399 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp5P56399 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp5P56399 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp5P56399 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp5P56399 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp5P56399 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp5P56399 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp5P56399 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp5P56399 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp5P56399 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp5P56399 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp5P56399 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp5P56399 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp5P56399 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp5P56399 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp5P56399 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp5P56399 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Usp5P56399 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Usp5P56399 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Usp5P56399 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Usp5P56399 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Usp5P56399 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp5P56399 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp5P56399 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Usp5P56399 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Usp5P56399 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp5P56399 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp5P56399 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp5P56399 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp5P56399 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp5P56399 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Usp5P56399 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp5P56399 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp5P56399 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Usp5P56399 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp5P56399 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Usp5P56399 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp5P56399 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp5P56399 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Usp5P56399 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Usp5P56399 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms