Protein–RNA interactions for Protein: P56382

Atp5e, ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5eP56382 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atp5eP56382 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atp5eP56382 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atp5eP56382 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atp5eP56382 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atp5eP56382 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atp5eP56382 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atp5eP56382 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atp5eP56382 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atp5eP56382 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atp5eP56382 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atp5eP56382 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atp5eP56382 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atp5eP56382 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atp5eP56382 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atp5eP56382 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atp5eP56382 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atp5eP56382 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atp5eP56382 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atp5eP56382 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp5eP56382 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp5eP56382 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp5eP56382 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp5eP56382 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp5eP56382 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp5eP56382 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp5eP56382 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp5eP56382 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp5eP56382 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp5eP56382 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp5eP56382 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp5eP56382 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp5eP56382 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp5eP56382 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp5eP56382 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp5eP56382 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp5eP56382 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp5eP56382 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp5eP56382 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp5eP56382 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp5eP56382 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp5eP56382 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp5eP56382 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp5eP56382 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp5eP56382 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp5eP56382 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp5eP56382 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp5eP56382 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp5eP56382 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp5eP56382 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp5eP56382 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp5eP56382 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp5eP56382 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp5eP56382 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp5eP56382 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp5eP56382 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp5eP56382 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp5eP56382 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp5eP56382 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp5eP56382 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp5eP56382 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp5eP56382 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp5eP56382 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp5eP56382 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp5eP56382 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp5eP56382 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp5eP56382 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp5eP56382 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp5eP56382 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp5eP56382 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp5eP56382 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp5eP56382 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp5eP56382 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp5eP56382 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp5eP56382 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp5eP56382 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp5eP56382 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp5eP56382 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp5eP56382 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp5eP56382 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp5eP56382 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp5eP56382 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp5eP56382 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp5eP56382 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp5eP56382 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp5eP56382 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp5eP56382 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp5eP56382 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp5eP56382 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp5eP56382 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp5eP56382 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp5eP56382 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp5eP56382 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp5eP56382 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp5eP56382 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp5eP56382 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp5eP56382 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp5eP56382 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp5eP56382 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp5eP56382 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms