Protein–RNA interactions for Protein: P54987

Acod1, Cis-aconitate decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acod1P54987 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Acod1P54987 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Acod1P54987 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Acod1P54987 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Acod1P54987 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Acod1P54987 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Acod1P54987 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Acod1P54987 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Acod1P54987 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Acod1P54987 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Acod1P54987 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Acod1P54987 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Acod1P54987 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Acod1P54987 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Acod1P54987 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Acod1P54987 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Acod1P54987 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Acod1P54987 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Acod1P54987 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Acod1P54987 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Acod1P54987 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Acod1P54987 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Acod1P54987 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Acod1P54987 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acod1P54987 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acod1P54987 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acod1P54987 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acod1P54987 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acod1P54987 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acod1P54987 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acod1P54987 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acod1P54987 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acod1P54987 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acod1P54987 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acod1P54987 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acod1P54987 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acod1P54987 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acod1P54987 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acod1P54987 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acod1P54987 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acod1P54987 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acod1P54987 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acod1P54987 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acod1P54987 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acod1P54987 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acod1P54987 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acod1P54987 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acod1P54987 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acod1P54987 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acod1P54987 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acod1P54987 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acod1P54987 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acod1P54987 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acod1P54987 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acod1P54987 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Acod1P54987 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acod1P54987 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acod1P54987 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Acod1P54987 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acod1P54987 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acod1P54987 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acod1P54987 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acod1P54987 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acod1P54987 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acod1P54987 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Acod1P54987 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Acod1P54987 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Acod1P54987 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Acod1P54987 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Acod1P54987 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Acod1P54987 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Acod1P54987 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Acod1P54987 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Acod1P54987 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Acod1P54987 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Acod1P54987 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Acod1P54987 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Acod1P54987 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Acod1P54987 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acod1P54987 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acod1P54987 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms