Protein–RNA interactions for Protein: P54728

Rad23b, UV excision repair protein RAD23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23bP54728 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rad23bP54728 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rad23bP54728 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rad23bP54728 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rad23bP54728 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Rad23bP54728 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Rad23bP54728 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rad23bP54728 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rad23bP54728 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rad23bP54728 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rad23bP54728 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rad23bP54728 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rad23bP54728 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rad23bP54728 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rad23bP54728 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rad23bP54728 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rad23bP54728 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rad23bP54728 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rad23bP54728 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rad23bP54728 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rad23bP54728 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rad23bP54728 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rad23bP54728 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rad23bP54728 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rad23bP54728 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rad23bP54728 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rad23bP54728 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Rad23bP54728 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Rad23bP54728 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rad23bP54728 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rad23bP54728 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rad23bP54728 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rad23bP54728 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rad23bP54728 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rad23bP54728 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rad23bP54728 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rad23bP54728 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rad23bP54728 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rad23bP54728 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rad23bP54728 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rad23bP54728 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rad23bP54728 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rad23bP54728 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rad23bP54728 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rad23bP54728 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rad23bP54728 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rad23bP54728 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rad23bP54728 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rad23bP54728 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rad23bP54728 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rad23bP54728 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rad23bP54728 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rad23bP54728 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rad23bP54728 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rad23bP54728 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rad23bP54728 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rad23bP54728 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rad23bP54728 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rad23bP54728 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rad23bP54728 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rad23bP54728 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rad23bP54728 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rad23bP54728 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rad23bP54728 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rad23bP54728 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rad23bP54728 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rad23bP54728 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rad23bP54728 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rad23bP54728 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rad23bP54728 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rad23bP54728 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rad23bP54728 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rad23bP54728 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rad23bP54728 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rad23bP54728 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rad23bP54728 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rad23bP54728 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rad23bP54728 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rad23bP54728 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rad23bP54728 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rad23bP54728 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rad23bP54728 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rad23bP54728 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rad23bP54728 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rad23bP54728 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rad23bP54728 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rad23bP54728 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rad23bP54728 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rad23bP54728 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rad23bP54728 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rad23bP54728 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rad23bP54728 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rad23bP54728 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rad23bP54728 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rad23bP54728 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rad23bP54728 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rad23bP54728 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rad23bP54728 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rad23bP54728 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rad23bP54728 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 139.4 ms