Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cacnb3P54285 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cacnb3P54285 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cacnb3P54285 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cacnb3P54285 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cacnb3P54285 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cacnb3P54285 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cacnb3P54285 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cacnb3P54285 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cacnb3P54285 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cacnb3P54285 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cacnb3P54285 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cacnb3P54285 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cacnb3P54285 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cacnb3P54285 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cacnb3P54285 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cacnb3P54285 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cacnb3P54285 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cacnb3P54285 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cacnb3P54285 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cacnb3P54285 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cacnb3P54285 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cacnb3P54285 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cacnb3P54285 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cacnb3P54285 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cacnb3P54285 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cacnb3P54285 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cacnb3P54285 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cacnb3P54285 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cacnb3P54285 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cacnb3P54285 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cacnb3P54285 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cacnb3P54285 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cacnb3P54285 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cacnb3P54285 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cacnb3P54285 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cacnb3P54285 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cacnb3P54285 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cacnb3P54285 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cacnb3P54285 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cacnb3P54285 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cacnb3P54285 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cacnb3P54285 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cacnb3P54285 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cacnb3P54285 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cacnb3P54285 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cacnb3P54285 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cacnb3P54285 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cacnb3P54285 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cacnb3P54285 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cacnb3P54285 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cacnb3P54285 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cacnb3P54285 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Cacnb3P54285 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cacnb3P54285 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cacnb3P54285 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cacnb3P54285 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Cacnb3P54285 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cacnb3P54285 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cacnb3P54285 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cacnb3P54285 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cacnb3P54285 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cacnb3P54285 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cacnb3P54285 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cacnb3P54285 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cacnb3P54285 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cacnb3P54285 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cacnb3P54285 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cacnb3P54285 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cacnb3P54285 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cacnb3P54285 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cacnb3P54285 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Cacnb3P54285 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cacnb3P54285 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cacnb3P54285 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cacnb3P54285 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cacnb3P54285 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cacnb3P54285 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cacnb3P54285 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cacnb3P54285 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cacnb3P54285 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cacnb3P54285 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Cacnb3P54285 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cacnb3P54285 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cacnb3P54285 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cacnb3P54285 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cacnb3P54285 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cacnb3P54285 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cacnb3P54285 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cacnb3P54285 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cacnb3P54285 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cacnb3P54285 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cacnb3P54285 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cacnb3P54285 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cacnb3P54285 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cacnb3P54285 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cacnb3P54285 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cacnb3P54285 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cacnb3P54285 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cacnb3P54285 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms