Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PctpP53808 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PctpP53808 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PctpP53808 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PctpP53808 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PctpP53808 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PctpP53808 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PctpP53808 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PctpP53808 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PctpP53808 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PctpP53808 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PctpP53808 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PctpP53808 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PctpP53808 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PctpP53808 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PctpP53808 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PctpP53808 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PctpP53808 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PctpP53808 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PctpP53808 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PctpP53808 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PctpP53808 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PctpP53808 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PctpP53808 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PctpP53808 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PctpP53808 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PctpP53808 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PctpP53808 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PctpP53808 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PctpP53808 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PctpP53808 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PctpP53808 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PctpP53808 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PctpP53808 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PctpP53808 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PctpP53808 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PctpP53808 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PctpP53808 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PctpP53808 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PctpP53808 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PctpP53808 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PctpP53808 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PctpP53808 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PctpP53808 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PctpP53808 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PctpP53808 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PctpP53808 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PctpP53808 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PctpP53808 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PctpP53808 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PctpP53808 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PctpP53808 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PctpP53808 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PctpP53808 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PctpP53808 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PctpP53808 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PctpP53808 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PctpP53808 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PctpP53808 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PctpP53808 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PctpP53808 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PctpP53808 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PctpP53808 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PctpP53808 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PctpP53808 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PctpP53808 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PctpP53808 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PctpP53808 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PctpP53808 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PctpP53808 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PctpP53808 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PctpP53808 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PctpP53808 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PctpP53808 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PctpP53808 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PctpP53808 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PctpP53808 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PctpP53808 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PctpP53808 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PctpP53808 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PctpP53808 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PctpP53808 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PctpP53808 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PctpP53808 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PctpP53808 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PctpP53808 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PctpP53808 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PctpP53808 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PctpP53808 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PctpP53808 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PctpP53808 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PctpP53808 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PctpP53808 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PctpP53808 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PctpP53808 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PctpP53808 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PctpP53808 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PctpP53808 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PctpP53808 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PctpP53808 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms