Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cux1P53564 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Cux1P53564 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cux1P53564 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cux1P53564 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cux1P53564 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cux1P53564 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cux1P53564 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cux1P53564 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Cux1P53564 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cux1P53564 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cux1P53564 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cux1P53564 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cux1P53564 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cux1P53564 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cux1P53564 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cux1P53564 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cux1P53564 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cux1P53564 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Cux1P53564 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Cux1P53564 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cux1P53564 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cux1P53564 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cux1P53564 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cux1P53564 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cux1P53564 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cux1P53564 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cux1P53564 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cux1P53564 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cux1P53564 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cux1P53564 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cux1P53564 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cux1P53564 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cux1P53564 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cux1P53564 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cux1P53564 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cux1P53564 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cux1P53564 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cux1P53564 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cux1P53564 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cux1P53564 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cux1P53564 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cux1P53564 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cux1P53564 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cux1P53564 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cux1P53564 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cux1P53564 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cux1P53564 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cux1P53564 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cux1P53564 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cux1P53564 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cux1P53564 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cux1P53564 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cux1P53564 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cux1P53564 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cux1P53564 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cux1P53564 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cux1P53564 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Cux1P53564 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cux1P53564 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cux1P53564 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cux1P53564 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cux1P53564 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cux1P53564 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cux1P53564 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cux1P53564 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cux1P53564 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cux1P53564 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cux1P53564 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cux1P53564 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cux1P53564 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cux1P53564 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cux1P53564 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cux1P53564 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cux1P53564 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Cux1P53564 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Cux1P53564 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cux1P53564 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cux1P53564 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cux1P53564 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cux1P53564 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cux1P53564 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cux1P53564 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cux1P53564 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cux1P53564 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Cux1P53564 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cux1P53564 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cux1P53564 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cux1P53564 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cux1P53564 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cux1P53564 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cux1P53564 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cux1P53564 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cux1P53564 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cux1P53564 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cux1P53564 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cux1P53564 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cux1P53564 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cux1P53564 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Cux1P53564 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms