Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Upp1P52624 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Upp1P52624 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Upp1P52624 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Upp1P52624 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Upp1P52624 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Upp1P52624 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Upp1P52624 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Upp1P52624 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Upp1P52624 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Upp1P52624 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Upp1P52624 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Upp1P52624 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Upp1P52624 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Upp1P52624 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Upp1P52624 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Upp1P52624 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Upp1P52624 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Upp1P52624 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Upp1P52624 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Upp1P52624 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Upp1P52624 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Upp1P52624 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Upp1P52624 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Upp1P52624 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Upp1P52624 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Upp1P52624 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Upp1P52624 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Upp1P52624 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Upp1P52624 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Upp1P52624 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Upp1P52624 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Upp1P52624 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Upp1P52624 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Upp1P52624 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Upp1P52624 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Upp1P52624 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Upp1P52624 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Upp1P52624 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Upp1P52624 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Upp1P52624 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Upp1P52624 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Upp1P52624 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Upp1P52624 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Upp1P52624 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Upp1P52624 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Upp1P52624 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Upp1P52624 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Upp1P52624 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Upp1P52624 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Upp1P52624 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Upp1P52624 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Upp1P52624 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Upp1P52624 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Upp1P52624 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Upp1P52624 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Upp1P52624 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Upp1P52624 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Upp1P52624 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Upp1P52624 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Upp1P52624 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Upp1P52624 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Upp1P52624 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Upp1P52624 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Upp1P52624 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Upp1P52624 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Upp1P52624 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Upp1P52624 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Upp1P52624 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Upp1P52624 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Upp1P52624 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Upp1P52624 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Upp1P52624 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Upp1P52624 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Upp1P52624 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Upp1P52624 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Upp1P52624 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Upp1P52624 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Upp1P52624 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Upp1P52624 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Upp1P52624 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Upp1P52624 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Upp1P52624 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Upp1P52624 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Upp1P52624 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Upp1P52624 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Upp1P52624 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Upp1P52624 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Upp1P52624 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Upp1P52624 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Upp1P52624 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Upp1P52624 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Upp1P52624 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Upp1P52624 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Upp1P52624 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Upp1P52624 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Upp1P52624 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Upp1P52624 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Upp1P52624 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Upp1P52624 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms