Protein–RNA interactions for Protein: P51612

Xpc, DNA repair protein complementing XP-C cells homolog, mousemouse

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XpcP51612 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
XpcP51612 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
XpcP51612 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
XpcP51612 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
XpcP51612 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
XpcP51612 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
XpcP51612 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
XpcP51612 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
XpcP51612 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
XpcP51612 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
XpcP51612 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
XpcP51612 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
XpcP51612 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
XpcP51612 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
XpcP51612 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
XpcP51612 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
XpcP51612 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
XpcP51612 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
XpcP51612 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
XpcP51612 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
XpcP51612 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
XpcP51612 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
XpcP51612 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
XpcP51612 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
XpcP51612 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
XpcP51612 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
XpcP51612 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
XpcP51612 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
XpcP51612 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
XpcP51612 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
XpcP51612 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
XpcP51612 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
XpcP51612 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
XpcP51612 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
XpcP51612 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
XpcP51612 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
XpcP51612 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
XpcP51612 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
XpcP51612 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
XpcP51612 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
XpcP51612 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
XpcP51612 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
XpcP51612 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
XpcP51612 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
XpcP51612 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
XpcP51612 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
XpcP51612 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
XpcP51612 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
XpcP51612 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
XpcP51612 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
XpcP51612 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
XpcP51612 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
XpcP51612 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
XpcP51612 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
XpcP51612 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
XpcP51612 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
XpcP51612 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
XpcP51612 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
XpcP51612 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
XpcP51612 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
XpcP51612 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
XpcP51612 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
XpcP51612 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
XpcP51612 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
XpcP51612 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
XpcP51612 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
XpcP51612 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
XpcP51612 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
XpcP51612 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
XpcP51612 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
XpcP51612 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
XpcP51612 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
XpcP51612 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
XpcP51612 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
XpcP51612 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
XpcP51612 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
XpcP51612 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
XpcP51612 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
XpcP51612 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
XpcP51612 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
XpcP51612 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
XpcP51612 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
XpcP51612 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
XpcP51612 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
XpcP51612 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
XpcP51612 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
XpcP51612 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
XpcP51612 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
XpcP51612 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
XpcP51612 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
XpcP51612 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
XpcP51612 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
XpcP51612 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
XpcP51612 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
XpcP51612 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
XpcP51612 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
XpcP51612 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
XpcP51612 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
XpcP51612 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
XpcP51612 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms