Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SftpdP50404 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SftpdP50404 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SftpdP50404 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
SftpdP50404 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SftpdP50404 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
SftpdP50404 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SftpdP50404 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SftpdP50404 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SftpdP50404 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SftpdP50404 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SftpdP50404 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
SftpdP50404 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SftpdP50404 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SftpdP50404 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SftpdP50404 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SftpdP50404 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SftpdP50404 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SftpdP50404 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SftpdP50404 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SftpdP50404 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SftpdP50404 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SftpdP50404 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SftpdP50404 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SftpdP50404 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SftpdP50404 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SftpdP50404 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SftpdP50404 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SftpdP50404 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SftpdP50404 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SftpdP50404 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SftpdP50404 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SftpdP50404 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SftpdP50404 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SftpdP50404 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SftpdP50404 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SftpdP50404 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SftpdP50404 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SftpdP50404 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SftpdP50404 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SftpdP50404 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SftpdP50404 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SftpdP50404 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SftpdP50404 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SftpdP50404 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SftpdP50404 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SftpdP50404 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SftpdP50404 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SftpdP50404 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SftpdP50404 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SftpdP50404 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SftpdP50404 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SftpdP50404 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SftpdP50404 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SftpdP50404 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SftpdP50404 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SftpdP50404 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SftpdP50404 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SftpdP50404 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SftpdP50404 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SftpdP50404 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SftpdP50404 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SftpdP50404 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SftpdP50404 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SftpdP50404 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SftpdP50404 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SftpdP50404 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SftpdP50404 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SftpdP50404 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SftpdP50404 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SftpdP50404 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SftpdP50404 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SftpdP50404 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SftpdP50404 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SftpdP50404 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SftpdP50404 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SftpdP50404 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SftpdP50404 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SftpdP50404 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SftpdP50404 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SftpdP50404 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SftpdP50404 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SftpdP50404 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SftpdP50404 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SftpdP50404 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SftpdP50404 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SftpdP50404 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SftpdP50404 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SftpdP50404 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SftpdP50404 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SftpdP50404 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SftpdP50404 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SftpdP50404 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SftpdP50404 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SftpdP50404 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SftpdP50404 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SftpdP50404 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SftpdP50404 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SftpdP50404 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SftpdP50404 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms