Protein–RNA interactions for Protein: P49717

Mcm4, DNA replication licensing factor MCM4, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcm4P49717 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mcm4P49717 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mcm4P49717 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mcm4P49717 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mcm4P49717 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mcm4P49717 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mcm4P49717 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Mcm4P49717 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Mcm4P49717 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mcm4P49717 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mcm4P49717 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mcm4P49717 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mcm4P49717 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mcm4P49717 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mcm4P49717 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mcm4P49717 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mcm4P49717 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mcm4P49717 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mcm4P49717 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mcm4P49717 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Mcm4P49717 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mcm4P49717 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mcm4P49717 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mcm4P49717 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mcm4P49717 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mcm4P49717 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mcm4P49717 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mcm4P49717 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mcm4P49717 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mcm4P49717 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mcm4P49717 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mcm4P49717 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mcm4P49717 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mcm4P49717 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mcm4P49717 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mcm4P49717 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mcm4P49717 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mcm4P49717 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mcm4P49717 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mcm4P49717 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mcm4P49717 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mcm4P49717 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Mcm4P49717 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mcm4P49717 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mcm4P49717 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mcm4P49717 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mcm4P49717 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mcm4P49717 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mcm4P49717 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mcm4P49717 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mcm4P49717 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Mcm4P49717 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mcm4P49717 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mcm4P49717 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mcm4P49717 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mcm4P49717 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mcm4P49717 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mcm4P49717 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mcm4P49717 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mcm4P49717 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mcm4P49717 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mcm4P49717 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mcm4P49717 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mcm4P49717 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mcm4P49717 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mcm4P49717 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mcm4P49717 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mcm4P49717 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mcm4P49717 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mcm4P49717 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mcm4P49717 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mcm4P49717 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mcm4P49717 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mcm4P49717 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mcm4P49717 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mcm4P49717 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mcm4P49717 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mcm4P49717 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mcm4P49717 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mcm4P49717 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mcm4P49717 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mcm4P49717 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mcm4P49717 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mcm4P49717 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mcm4P49717 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mcm4P49717 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mcm4P49717 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mcm4P49717 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mcm4P49717 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mcm4P49717 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mcm4P49717 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mcm4P49717 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mcm4P49717 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Mcm4P49717 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mcm4P49717 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mcm4P49717 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mcm4P49717 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mcm4P49717 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mcm4P49717 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mcm4P49717 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms