Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnni3P48787 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnni3P48787 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnni3P48787 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnni3P48787 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnni3P48787 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnni3P48787 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnni3P48787 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnni3P48787 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnni3P48787 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnni3P48787 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnni3P48787 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnni3P48787 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnni3P48787 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnni3P48787 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnni3P48787 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnni3P48787 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnni3P48787 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnni3P48787 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnni3P48787 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnni3P48787 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnni3P48787 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnni3P48787 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnni3P48787 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnni3P48787 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnni3P48787 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnni3P48787 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnni3P48787 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnni3P48787 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnni3P48787 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnni3P48787 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnni3P48787 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnni3P48787 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnni3P48787 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnni3P48787 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnni3P48787 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnni3P48787 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnni3P48787 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnni3P48787 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnni3P48787 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnni3P48787 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnni3P48787 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnni3P48787 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnni3P48787 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnni3P48787 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnni3P48787 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnni3P48787 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnni3P48787 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnni3P48787 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnni3P48787 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnni3P48787 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnni3P48787 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnni3P48787 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnni3P48787 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnni3P48787 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnni3P48787 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnni3P48787 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnni3P48787 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnni3P48787 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnni3P48787 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnni3P48787 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnni3P48787 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnni3P48787 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnni3P48787 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnni3P48787 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnni3P48787 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnni3P48787 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnni3P48787 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnni3P48787 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnni3P48787 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnni3P48787 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnni3P48787 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnni3P48787 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnni3P48787 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnni3P48787 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnni3P48787 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnni3P48787 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnni3P48787 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnni3P48787 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnni3P48787 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnni3P48787 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnni3P48787 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnni3P48787 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnni3P48787 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnni3P48787 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnni3P48787 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnni3P48787 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnni3P48787 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnni3P48787 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnni3P48787 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnni3P48787 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnni3P48787 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnni3P48787 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnni3P48787 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnni3P48787 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnni3P48787 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnni3P48787 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnni3P48787 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnni3P48787 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnni3P48787 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms