Protein–RNA interactions for Protein: P48754

Brca1, Breast cancer type 1 susceptibility protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca1P48754 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Brca1P48754 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Brca1P48754 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Brca1P48754 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Brca1P48754 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Brca1P48754 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Brca1P48754 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Brca1P48754 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Brca1P48754 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Brca1P48754 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Brca1P48754 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Brca1P48754 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Brca1P48754 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Brca1P48754 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Brca1P48754 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Brca1P48754 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Brca1P48754 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Brca1P48754 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Brca1P48754 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Brca1P48754 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Brca1P48754 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Brca1P48754 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Brca1P48754 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Brca1P48754 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Brca1P48754 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Brca1P48754 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Brca1P48754 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Brca1P48754 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Brca1P48754 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Brca1P48754 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Brca1P48754 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Brca1P48754 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Brca1P48754 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Brca1P48754 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Brca1P48754 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Brca1P48754 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Brca1P48754 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Brca1P48754 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Brca1P48754 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Brca1P48754 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Brca1P48754 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Brca1P48754 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Brca1P48754 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Brca1P48754 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Brca1P48754 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Brca1P48754 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Brca1P48754 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Brca1P48754 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Brca1P48754 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Brca1P48754 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Brca1P48754 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Brca1P48754 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Brca1P48754 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Brca1P48754 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Brca1P48754 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Brca1P48754 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Brca1P48754 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Brca1P48754 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Brca1P48754 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Brca1P48754 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Brca1P48754 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Brca1P48754 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Brca1P48754 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Brca1P48754 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Brca1P48754 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Brca1P48754 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Brca1P48754 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Brca1P48754 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Brca1P48754 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Brca1P48754 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Brca1P48754 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Brca1P48754 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Brca1P48754 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Brca1P48754 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Brca1P48754 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Brca1P48754 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Brca1P48754 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Brca1P48754 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Brca1P48754 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Brca1P48754 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Brca1P48754 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Brca1P48754 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Brca1P48754 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Brca1P48754 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Brca1P48754 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Brca1P48754 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Brca1P48754 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Brca1P48754 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Brca1P48754 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Brca1P48754 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Brca1P48754 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Brca1P48754 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Brca1P48754 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Brca1P48754 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Brca1P48754 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Brca1P48754 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Brca1P48754 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Brca1P48754 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Brca1P48754 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Brca1P48754 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms