Protein–RNA interactions for Protein: P48030

Tgfa, Protransforming growth factor alpha, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfaP48030 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TgfaP48030 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TgfaP48030 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TgfaP48030 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TgfaP48030 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TgfaP48030 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TgfaP48030 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TgfaP48030 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TgfaP48030 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TgfaP48030 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TgfaP48030 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TgfaP48030 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TgfaP48030 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TgfaP48030 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TgfaP48030 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TgfaP48030 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TgfaP48030 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TgfaP48030 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TgfaP48030 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TgfaP48030 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TgfaP48030 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TgfaP48030 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TgfaP48030 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TgfaP48030 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TgfaP48030 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TgfaP48030 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TgfaP48030 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TgfaP48030 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TgfaP48030 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TgfaP48030 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TgfaP48030 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TgfaP48030 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TgfaP48030 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TgfaP48030 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TgfaP48030 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TgfaP48030 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TgfaP48030 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TgfaP48030 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TgfaP48030 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TgfaP48030 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TgfaP48030 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TgfaP48030 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TgfaP48030 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TgfaP48030 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TgfaP48030 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TgfaP48030 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TgfaP48030 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TgfaP48030 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TgfaP48030 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TgfaP48030 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TgfaP48030 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TgfaP48030 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TgfaP48030 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TgfaP48030 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TgfaP48030 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TgfaP48030 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TgfaP48030 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TgfaP48030 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TgfaP48030 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TgfaP48030 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TgfaP48030 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TgfaP48030 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TgfaP48030 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TgfaP48030 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TgfaP48030 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TgfaP48030 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TgfaP48030 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TgfaP48030 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TgfaP48030 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TgfaP48030 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TgfaP48030 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TgfaP48030 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TgfaP48030 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TgfaP48030 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TgfaP48030 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TgfaP48030 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TgfaP48030 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TgfaP48030 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TgfaP48030 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TgfaP48030 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TgfaP48030 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TgfaP48030 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TgfaP48030 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TgfaP48030 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TgfaP48030 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TgfaP48030 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TgfaP48030 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TgfaP48030 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TgfaP48030 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TgfaP48030 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TgfaP48030 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TgfaP48030 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TgfaP48030 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TgfaP48030 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TgfaP48030 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TgfaP48030 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TgfaP48030 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TgfaP48030 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TgfaP48030 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TgfaP48030 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms