Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SrprbP47758 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SrprbP47758 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SrprbP47758 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SrprbP47758 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SrprbP47758 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SrprbP47758 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SrprbP47758 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SrprbP47758 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SrprbP47758 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SrprbP47758 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SrprbP47758 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SrprbP47758 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SrprbP47758 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SrprbP47758 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SrprbP47758 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SrprbP47758 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SrprbP47758 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SrprbP47758 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SrprbP47758 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SrprbP47758 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SrprbP47758 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SrprbP47758 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SrprbP47758 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SrprbP47758 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SrprbP47758 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SrprbP47758 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SrprbP47758 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SrprbP47758 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SrprbP47758 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SrprbP47758 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SrprbP47758 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SrprbP47758 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SrprbP47758 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SrprbP47758 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SrprbP47758 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SrprbP47758 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SrprbP47758 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SrprbP47758 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SrprbP47758 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SrprbP47758 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SrprbP47758 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SrprbP47758 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SrprbP47758 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SrprbP47758 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SrprbP47758 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SrprbP47758 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SrprbP47758 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SrprbP47758 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SrprbP47758 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SrprbP47758 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SrprbP47758 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SrprbP47758 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SrprbP47758 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SrprbP47758 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SrprbP47758 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SrprbP47758 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SrprbP47758 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SrprbP47758 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SrprbP47758 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SrprbP47758 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SrprbP47758 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SrprbP47758 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SrprbP47758 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SrprbP47758 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SrprbP47758 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SrprbP47758 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SrprbP47758 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SrprbP47758 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SrprbP47758 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SrprbP47758 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SrprbP47758 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SrprbP47758 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SrprbP47758 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SrprbP47758 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SrprbP47758 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SrprbP47758 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SrprbP47758 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SrprbP47758 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SrprbP47758 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SrprbP47758 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SrprbP47758 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SrprbP47758 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
SrprbP47758 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SrprbP47758 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SrprbP47758 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SrprbP47758 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SrprbP47758 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SrprbP47758 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SrprbP47758 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SrprbP47758 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SrprbP47758 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SrprbP47758 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SrprbP47758 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SrprbP47758 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SrprbP47758 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SrprbP47758 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SrprbP47758 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SrprbP47758 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SrprbP47758 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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