Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ItgavP43406 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ItgavP43406 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ItgavP43406 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ItgavP43406 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ItgavP43406 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ItgavP43406 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ItgavP43406 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ItgavP43406 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ItgavP43406 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ItgavP43406 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ItgavP43406 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ItgavP43406 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ItgavP43406 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ItgavP43406 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ItgavP43406 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ItgavP43406 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ItgavP43406 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ItgavP43406 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ItgavP43406 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ItgavP43406 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ItgavP43406 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ItgavP43406 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
ItgavP43406 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ItgavP43406 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
ItgavP43406 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ItgavP43406 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ItgavP43406 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ItgavP43406 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ItgavP43406 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ItgavP43406 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ItgavP43406 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ItgavP43406 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ItgavP43406 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ItgavP43406 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ItgavP43406 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ItgavP43406 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ItgavP43406 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ItgavP43406 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ItgavP43406 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ItgavP43406 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ItgavP43406 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ItgavP43406 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ItgavP43406 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ItgavP43406 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ItgavP43406 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ItgavP43406 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ItgavP43406 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ItgavP43406 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ItgavP43406 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ItgavP43406 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ItgavP43406 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ItgavP43406 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ItgavP43406 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ItgavP43406 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ItgavP43406 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ItgavP43406 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ItgavP43406 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ItgavP43406 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ItgavP43406 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ItgavP43406 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ItgavP43406 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ItgavP43406 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ItgavP43406 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ItgavP43406 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ItgavP43406 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ItgavP43406 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ItgavP43406 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ItgavP43406 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ItgavP43406 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ItgavP43406 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ItgavP43406 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ItgavP43406 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ItgavP43406 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ItgavP43406 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ItgavP43406 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ItgavP43406 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ItgavP43406 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ItgavP43406 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ItgavP43406 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ItgavP43406 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ItgavP43406 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ItgavP43406 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ItgavP43406 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ItgavP43406 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ItgavP43406 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ItgavP43406 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ItgavP43406 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ItgavP43406 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ItgavP43406 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ItgavP43406 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ItgavP43406 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ItgavP43406 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ItgavP43406 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ItgavP43406 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ItgavP43406 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ItgavP43406 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ItgavP43406 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ItgavP43406 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ItgavP43406 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms