Protein–RNA interactions for Protein: P43027

Gdf5, Growth/differentiation factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf5P43027 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gdf5P43027 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gdf5P43027 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gdf5P43027 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gdf5P43027 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gdf5P43027 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gdf5P43027 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gdf5P43027 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Gdf5P43027 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gdf5P43027 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gdf5P43027 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Gdf5P43027 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gdf5P43027 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gdf5P43027 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gdf5P43027 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gdf5P43027 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gdf5P43027 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gdf5P43027 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gdf5P43027 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gdf5P43027 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gdf5P43027 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gdf5P43027 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gdf5P43027 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gdf5P43027 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gdf5P43027 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gdf5P43027 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gdf5P43027 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Gdf5P43027 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Gdf5P43027 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gdf5P43027 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gdf5P43027 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gdf5P43027 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gdf5P43027 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gdf5P43027 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gdf5P43027 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gdf5P43027 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gdf5P43027 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gdf5P43027 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gdf5P43027 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gdf5P43027 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gdf5P43027 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gdf5P43027 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gdf5P43027 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gdf5P43027 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gdf5P43027 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gdf5P43027 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gdf5P43027 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gdf5P43027 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gdf5P43027 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gdf5P43027 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gdf5P43027 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gdf5P43027 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gdf5P43027 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gdf5P43027 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gdf5P43027 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gdf5P43027 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gdf5P43027 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gdf5P43027 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gdf5P43027 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Gdf5P43027 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gdf5P43027 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gdf5P43027 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gdf5P43027 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gdf5P43027 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gdf5P43027 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gdf5P43027 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gdf5P43027 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gdf5P43027 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gdf5P43027 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gdf5P43027 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gdf5P43027 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gdf5P43027 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gdf5P43027 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gdf5P43027 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gdf5P43027 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gdf5P43027 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gdf5P43027 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gdf5P43027 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gdf5P43027 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gdf5P43027 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gdf5P43027 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gdf5P43027 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gdf5P43027 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gdf5P43027 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gdf5P43027 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gdf5P43027 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gdf5P43027 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gdf5P43027 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gdf5P43027 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gdf5P43027 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gdf5P43027 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gdf5P43027 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gdf5P43027 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gdf5P43027 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gdf5P43027 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gdf5P43027 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gdf5P43027 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gdf5P43027 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gdf5P43027 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gdf5P43027 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms