Protein–RNA interactions for Protein: P42703

Lifr, Leukemia inhibitory factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,092 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LifrP42703 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LifrP42703 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LifrP42703 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LifrP42703 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LifrP42703 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LifrP42703 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LifrP42703 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LifrP42703 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LifrP42703 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LifrP42703 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LifrP42703 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LifrP42703 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LifrP42703 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LifrP42703 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LifrP42703 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LifrP42703 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LifrP42703 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LifrP42703 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LifrP42703 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LifrP42703 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LifrP42703 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
LifrP42703 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LifrP42703 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LifrP42703 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LifrP42703 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LifrP42703 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LifrP42703 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LifrP42703 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LifrP42703 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LifrP42703 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LifrP42703 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LifrP42703 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LifrP42703 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LifrP42703 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LifrP42703 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LifrP42703 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LifrP42703 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LifrP42703 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LifrP42703 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LifrP42703 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LifrP42703 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LifrP42703 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LifrP42703 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LifrP42703 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LifrP42703 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LifrP42703 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LifrP42703 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LifrP42703 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LifrP42703 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LifrP42703 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LifrP42703 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LifrP42703 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LifrP42703 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LifrP42703 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LifrP42703 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LifrP42703 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LifrP42703 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LifrP42703 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LifrP42703 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LifrP42703 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LifrP42703 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LifrP42703 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LifrP42703 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LifrP42703 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LifrP42703 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LifrP42703 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LifrP42703 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LifrP42703 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LifrP42703 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LifrP42703 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LifrP42703 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LifrP42703 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LifrP42703 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LifrP42703 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LifrP42703 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LifrP42703 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LifrP42703 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LifrP42703 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LifrP42703 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LifrP42703 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LifrP42703 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LifrP42703 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LifrP42703 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LifrP42703 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LifrP42703 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LifrP42703 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LifrP42703 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LifrP42703 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LifrP42703 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LifrP42703 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LifrP42703 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LifrP42703 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LifrP42703 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LifrP42703 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LifrP42703 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LifrP42703 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LifrP42703 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LifrP42703 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LifrP42703 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LifrP42703 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms