Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nkx1-2P42580 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nkx1-2P42580 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nkx1-2P42580 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nkx1-2P42580 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nkx1-2P42580 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nkx1-2P42580 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nkx1-2P42580 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nkx1-2P42580 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nkx1-2P42580 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nkx1-2P42580 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nkx1-2P42580 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nkx1-2P42580 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nkx1-2P42580 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nkx1-2P42580 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nkx1-2P42580 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nkx1-2P42580 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nkx1-2P42580 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nkx1-2P42580 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nkx1-2P42580 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nkx1-2P42580 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nkx1-2P42580 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nkx1-2P42580 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nkx1-2P42580 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nkx1-2P42580 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nkx1-2P42580 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nkx1-2P42580 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nkx1-2P42580 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nkx1-2P42580 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nkx1-2P42580 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nkx1-2P42580 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nkx1-2P42580 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nkx1-2P42580 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nkx1-2P42580 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nkx1-2P42580 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nkx1-2P42580 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nkx1-2P42580 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nkx1-2P42580 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nkx1-2P42580 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nkx1-2P42580 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nkx1-2P42580 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nkx1-2P42580 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nkx1-2P42580 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nkx1-2P42580 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nkx1-2P42580 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nkx1-2P42580 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nkx1-2P42580 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nkx1-2P42580 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nkx1-2P42580 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nkx1-2P42580 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nkx1-2P42580 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nkx1-2P42580 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nkx1-2P42580 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nkx1-2P42580 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nkx1-2P42580 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nkx1-2P42580 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nkx1-2P42580 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nkx1-2P42580 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nkx1-2P42580 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nkx1-2P42580 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nkx1-2P42580 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nkx1-2P42580 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nkx1-2P42580 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nkx1-2P42580 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nkx1-2P42580 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nkx1-2P42580 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nkx1-2P42580 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nkx1-2P42580 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nkx1-2P42580 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Nkx1-2P42580 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nkx1-2P42580 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nkx1-2P42580 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nkx1-2P42580 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nkx1-2P42580 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nkx1-2P42580 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nkx1-2P42580 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nkx1-2P42580 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nkx1-2P42580 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nkx1-2P42580 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nkx1-2P42580 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nkx1-2P42580 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Nkx1-2P42580 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nkx1-2P42580 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nkx1-2P42580 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nkx1-2P42580 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nkx1-2P42580 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nkx1-2P42580 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nkx1-2P42580 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nkx1-2P42580 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nkx1-2P42580 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nkx1-2P42580 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nkx1-2P42580 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nkx1-2P42580 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nkx1-2P42580 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nkx1-2P42580 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nkx1-2P42580 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nkx1-2P42580 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nkx1-2P42580 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nkx1-2P42580 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nkx1-2P42580 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.8 ms