Protein–RNA interactions for Protein: P41539

Tac1, Protachykinin-1, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tac1P41539 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tac1P41539 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tac1P41539 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tac1P41539 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tac1P41539 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tac1P41539 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tac1P41539 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tac1P41539 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tac1P41539 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tac1P41539 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tac1P41539 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tac1P41539 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tac1P41539 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tac1P41539 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tac1P41539 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tac1P41539 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tac1P41539 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tac1P41539 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tac1P41539 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tac1P41539 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tac1P41539 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tac1P41539 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tac1P41539 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tac1P41539 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tac1P41539 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tac1P41539 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tac1P41539 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tac1P41539 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tac1P41539 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tac1P41539 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tac1P41539 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tac1P41539 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tac1P41539 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tac1P41539 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tac1P41539 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tac1P41539 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tac1P41539 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tac1P41539 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tac1P41539 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tac1P41539 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tac1P41539 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tac1P41539 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tac1P41539 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tac1P41539 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tac1P41539 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tac1P41539 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tac1P41539 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tac1P41539 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tac1P41539 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tac1P41539 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tac1P41539 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tac1P41539 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tac1P41539 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tac1P41539 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tac1P41539 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tac1P41539 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tac1P41539 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tac1P41539 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tac1P41539 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tac1P41539 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tac1P41539 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tac1P41539 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tac1P41539 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tac1P41539 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tac1P41539 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tac1P41539 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tac1P41539 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tac1P41539 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tac1P41539 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tac1P41539 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tac1P41539 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tac1P41539 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tac1P41539 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tac1P41539 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tac1P41539 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tac1P41539 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tac1P41539 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tac1P41539 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tac1P41539 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tac1P41539 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tac1P41539 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tac1P41539 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tac1P41539 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tac1P41539 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tac1P41539 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tac1P41539 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tac1P41539 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tac1P41539 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tac1P41539 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tac1P41539 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tac1P41539 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tac1P41539 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tac1P41539 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tac1P41539 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tac1P41539 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tac1P41539 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tac1P41539 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tac1P41539 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tac1P41539 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tac1P41539 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms