Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LtbP41155 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LtbP41155 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LtbP41155 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LtbP41155 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LtbP41155 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LtbP41155 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LtbP41155 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LtbP41155 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LtbP41155 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LtbP41155 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LtbP41155 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LtbP41155 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LtbP41155 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LtbP41155 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LtbP41155 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LtbP41155 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LtbP41155 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LtbP41155 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LtbP41155 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LtbP41155 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LtbP41155 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LtbP41155 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LtbP41155 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LtbP41155 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LtbP41155 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LtbP41155 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LtbP41155 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LtbP41155 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LtbP41155 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LtbP41155 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LtbP41155 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LtbP41155 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LtbP41155 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LtbP41155 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LtbP41155 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LtbP41155 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LtbP41155 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LtbP41155 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LtbP41155 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LtbP41155 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LtbP41155 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LtbP41155 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LtbP41155 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LtbP41155 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LtbP41155 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LtbP41155 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LtbP41155 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LtbP41155 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LtbP41155 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LtbP41155 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LtbP41155 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LtbP41155 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LtbP41155 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LtbP41155 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LtbP41155 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LtbP41155 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LtbP41155 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LtbP41155 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LtbP41155 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LtbP41155 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LtbP41155 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LtbP41155 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LtbP41155 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LtbP41155 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LtbP41155 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LtbP41155 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LtbP41155 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LtbP41155 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LtbP41155 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LtbP41155 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LtbP41155 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LtbP41155 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LtbP41155 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LtbP41155 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LtbP41155 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LtbP41155 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LtbP41155 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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LtbP41155 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LtbP41155 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LtbP41155 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
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LtbP41155 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LtbP41155 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LtbP41155 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LtbP41155 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LtbP41155 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LtbP41155 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LtbP41155 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LtbP41155 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LtbP41155 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LtbP41155 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LtbP41155 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LtbP41155 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LtbP41155 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LtbP41155 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LtbP41155 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LtbP41155 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LtbP41155 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms