Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VhlP40338 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VhlP40338 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VhlP40338 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
VhlP40338 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VhlP40338 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VhlP40338 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VhlP40338 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VhlP40338 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VhlP40338 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VhlP40338 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VhlP40338 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VhlP40338 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VhlP40338 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VhlP40338 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VhlP40338 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VhlP40338 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VhlP40338 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VhlP40338 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VhlP40338 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VhlP40338 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VhlP40338 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VhlP40338 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VhlP40338 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VhlP40338 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VhlP40338 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VhlP40338 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VhlP40338 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VhlP40338 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VhlP40338 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VhlP40338 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VhlP40338 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VhlP40338 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VhlP40338 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VhlP40338 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VhlP40338 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.06■□□□□ 0
VhlP40338 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VhlP40338 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VhlP40338 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VhlP40338 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VhlP40338 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VhlP40338 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VhlP40338 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VhlP40338 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
VhlP40338 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
VhlP40338 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VhlP40338 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VhlP40338 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VhlP40338 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VhlP40338 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VhlP40338 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VhlP40338 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VhlP40338 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VhlP40338 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VhlP40338 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VhlP40338 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VhlP40338 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VhlP40338 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VhlP40338 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VhlP40338 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VhlP40338 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VhlP40338 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VhlP40338 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VhlP40338 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VhlP40338 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ 0
VhlP40338 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
VhlP40338 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
VhlP40338 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VhlP40338 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.05■□□□□ -0
VhlP40338 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VhlP40338 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.05■□□□□ -0
VhlP40338 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.05■□□□□ -0
VhlP40338 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VhlP40338 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.05■□□□□ -0
VhlP40338 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VhlP40338 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VhlP40338 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VhlP40338 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VhlP40338 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VhlP40338 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VhlP40338 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VhlP40338 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
VhlP40338 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VhlP40338 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VhlP40338 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VhlP40338 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VhlP40338 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VhlP40338 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
VhlP40338 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VhlP40338 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VhlP40338 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VhlP40338 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.04■□□□□ -0
VhlP40338 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VhlP40338 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VhlP40338 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VhlP40338 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VhlP40338 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VhlP40338 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VhlP40338 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VhlP40338 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms