Protein–RNA interactions for Protein: P40223

Csf3r, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3rP40223 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Csf3rP40223 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Csf3rP40223 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Csf3rP40223 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Csf3rP40223 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Csf3rP40223 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Csf3rP40223 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Csf3rP40223 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Csf3rP40223 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Csf3rP40223 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Csf3rP40223 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Csf3rP40223 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Csf3rP40223 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Csf3rP40223 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Csf3rP40223 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Csf3rP40223 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Csf3rP40223 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Csf3rP40223 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Csf3rP40223 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Csf3rP40223 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Csf3rP40223 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Csf3rP40223 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Csf3rP40223 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Csf3rP40223 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Csf3rP40223 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Csf3rP40223 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Csf3rP40223 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Csf3rP40223 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Csf3rP40223 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Csf3rP40223 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Csf3rP40223 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Csf3rP40223 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Csf3rP40223 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Csf3rP40223 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Csf3rP40223 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Csf3rP40223 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Csf3rP40223 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Csf3rP40223 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Csf3rP40223 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Csf3rP40223 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Csf3rP40223 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Csf3rP40223 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Csf3rP40223 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Csf3rP40223 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Csf3rP40223 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Csf3rP40223 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Csf3rP40223 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Csf3rP40223 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Csf3rP40223 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Csf3rP40223 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Csf3rP40223 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Csf3rP40223 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Csf3rP40223 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Csf3rP40223 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Csf3rP40223 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Csf3rP40223 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Csf3rP40223 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Csf3rP40223 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Csf3rP40223 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Csf3rP40223 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Csf3rP40223 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Csf3rP40223 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Csf3rP40223 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Csf3rP40223 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Csf3rP40223 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csf3rP40223 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csf3rP40223 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csf3rP40223 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csf3rP40223 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csf3rP40223 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csf3rP40223 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csf3rP40223 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csf3rP40223 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csf3rP40223 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Csf3rP40223 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Csf3rP40223 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Csf3rP40223 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csf3rP40223 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csf3rP40223 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csf3rP40223 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csf3rP40223 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csf3rP40223 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Csf3rP40223 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Csf3rP40223 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Csf3rP40223 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Csf3rP40223 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Csf3rP40223 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Csf3rP40223 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Csf3rP40223 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.4 ms