Protein–RNA interactions for Protein: P39749

Fen1, Flap endonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fen1P39749 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fen1P39749 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fen1P39749 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fen1P39749 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fen1P39749 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fen1P39749 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fen1P39749 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fen1P39749 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fen1P39749 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fen1P39749 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fen1P39749 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fen1P39749 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fen1P39749 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fen1P39749 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fen1P39749 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fen1P39749 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fen1P39749 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fen1P39749 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Fen1P39749 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fen1P39749 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fen1P39749 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Fen1P39749 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fen1P39749 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fen1P39749 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fen1P39749 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fen1P39749 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fen1P39749 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fen1P39749 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fen1P39749 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fen1P39749 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fen1P39749 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fen1P39749 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fen1P39749 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fen1P39749 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fen1P39749 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fen1P39749 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fen1P39749 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fen1P39749 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fen1P39749 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Fen1P39749 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fen1P39749 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fen1P39749 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Fen1P39749 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fen1P39749 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fen1P39749 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fen1P39749 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fen1P39749 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fen1P39749 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fen1P39749 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fen1P39749 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fen1P39749 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fen1P39749 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fen1P39749 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fen1P39749 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fen1P39749 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fen1P39749 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fen1P39749 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fen1P39749 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fen1P39749 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fen1P39749 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Fen1P39749 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fen1P39749 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fen1P39749 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fen1P39749 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fen1P39749 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fen1P39749 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Fen1P39749 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fen1P39749 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fen1P39749 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fen1P39749 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Fen1P39749 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fen1P39749 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fen1P39749 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fen1P39749 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fen1P39749 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fen1P39749 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fen1P39749 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fen1P39749 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fen1P39749 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fen1P39749 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fen1P39749 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fen1P39749 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fen1P39749 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fen1P39749 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fen1P39749 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fen1P39749 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fen1P39749 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fen1P39749 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fen1P39749 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fen1P39749 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fen1P39749 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fen1P39749 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fen1P39749 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fen1P39749 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fen1P39749 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fen1P39749 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fen1P39749 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fen1P39749 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fen1P39749 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fen1P39749 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms