Protein–RNA interactions for Protein: P39447

Tjp1, Tight junction protein ZO-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tjp1P39447 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tjp1P39447 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tjp1P39447 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tjp1P39447 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tjp1P39447 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tjp1P39447 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tjp1P39447 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tjp1P39447 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tjp1P39447 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tjp1P39447 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tjp1P39447 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tjp1P39447 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Tjp1P39447 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tjp1P39447 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tjp1P39447 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tjp1P39447 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tjp1P39447 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Tjp1P39447 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tjp1P39447 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tjp1P39447 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tjp1P39447 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tjp1P39447 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Tjp1P39447 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tjp1P39447 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tjp1P39447 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tjp1P39447 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tjp1P39447 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tjp1P39447 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tjp1P39447 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tjp1P39447 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tjp1P39447 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tjp1P39447 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tjp1P39447 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tjp1P39447 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tjp1P39447 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tjp1P39447 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tjp1P39447 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tjp1P39447 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tjp1P39447 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tjp1P39447 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tjp1P39447 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tjp1P39447 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tjp1P39447 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Tjp1P39447 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Tjp1P39447 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Tjp1P39447 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Tjp1P39447 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tjp1P39447 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tjp1P39447 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tjp1P39447 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tjp1P39447 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tjp1P39447 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tjp1P39447 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tjp1P39447 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tjp1P39447 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tjp1P39447 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tjp1P39447 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tjp1P39447 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tjp1P39447 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tjp1P39447 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tjp1P39447 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tjp1P39447 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tjp1P39447 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tjp1P39447 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tjp1P39447 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tjp1P39447 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tjp1P39447 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tjp1P39447 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tjp1P39447 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tjp1P39447 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tjp1P39447 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tjp1P39447 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tjp1P39447 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tjp1P39447 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tjp1P39447 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tjp1P39447 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tjp1P39447 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tjp1P39447 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tjp1P39447 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tjp1P39447 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tjp1P39447 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tjp1P39447 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tjp1P39447 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tjp1P39447 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tjp1P39447 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tjp1P39447 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tjp1P39447 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tjp1P39447 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tjp1P39447 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tjp1P39447 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tjp1P39447 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tjp1P39447 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Tjp1P39447 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tjp1P39447 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tjp1P39447 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tjp1P39447 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tjp1P39447 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tjp1P39447 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tjp1P39447 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tjp1P39447 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms